72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2796 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  64.29 
 
 
995 aa  1224    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  100 
 
 
936 aa  1906    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  30.83 
 
 
872 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.98 
 
 
961 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 
998 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.92 
 
 
965 aa  220  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.43 
 
 
887 aa  187  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  24.26 
 
 
921 aa  181  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.09 
 
 
946 aa  177  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.48 
 
 
929 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.41 
 
 
847 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.61 
 
 
924 aa  160  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  24.65 
 
 
929 aa  151  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  24.12 
 
 
904 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.9 
 
 
930 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.21 
 
 
926 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  24.01 
 
 
908 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  32.62 
 
 
952 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  31.58 
 
 
920 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.19 
 
 
805 aa  94.4  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.25 
 
 
944 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.2 
 
 
804 aa  83.2  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 
810 aa  81.3  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.31 
 
 
915 aa  80.9  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  27.11 
 
 
946 aa  78.2  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 
817 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  28.09 
 
 
895 aa  77.8  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  27.59 
 
 
879 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 
766 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 
827 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  21.62 
 
 
847 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 
819 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  21.35 
 
 
816 aa  68.9  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 
803 aa  67.8  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 
805 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  25.19 
 
 
877 aa  65.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  21.49 
 
 
817 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
826 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 
973 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
829 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
832 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  22.9 
 
 
806 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  21.53 
 
 
808 aa  62  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  27.6 
 
 
891 aa  61.6  0.00000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
821 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.61 
 
 
894 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 
824 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 
791 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  20.86 
 
 
830 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  22.77 
 
 
852 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
802 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.06 
 
 
818 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  21.84 
 
 
813 aa  54.7  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 
725 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  22.29 
 
 
814 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 
611 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
818 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 
869 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
814 aa  52  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 
883 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  20.38 
 
 
812 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
794 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 
813 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  24.65 
 
 
812 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 
798 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
820 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  21.42 
 
 
813 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 
800 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
866 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 
1041 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  25.27 
 
 
800 aa  45.1  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  23.85 
 
 
799 aa  44.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>