99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2202 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  31.21 
 
 		 936 aa  376  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.92 
 
 		 961 aa  293  9e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.11 
 
 		 887 aa  211  5e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  29.76 
 
 		 995 aa  204  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.32 
 
 		 965 aa  197  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.44 
 
 		 847 aa  193  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  24.13 
 
 		 921 aa  184  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  25.19 
 
 		 929 aa  181  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  23.77 
 
 		 952 aa  171  8e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  32.96 
 
 		 930 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 998 aa  164  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  23.39 
 
 		 904 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  30.94 
 
 		 924 aa  137  7.000000000000001e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  33.22 
 
 		 908 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  30.53 
 
 		 920 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  30.71 
 
 		 929 aa  124  9e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  28.14 
 
 		 944 aa  111  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  28.45 
 
 		 926 aa  107  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.6 
 
 		 895 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.03 
 
 		 915 aa  104  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 813 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  21.34 
 
 		 820 aa  96.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  22.14 
 
 		 830 aa  95.5  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  28.75 
 
 		 946 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 804 aa  95.1  6e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  28.7 
 
 		 891 aa  93.6  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 802 aa  89.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  22.88 
 
 		 810 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  27.59 
 
 		 879 aa  82.4  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  22.39 
 
 		 805 aa  81.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 817 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.6 
 
 		 946 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  21.65 
 
 		 815 aa  78.2  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 791 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 829 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 853 aa  74.3  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 817 aa  74.3  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  23.16 
 
 		 828 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  25.98 
 
 		 877 aa  73.2  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  20.6 
 
 		 819 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 866 aa  72  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 852 aa  71.6  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 869 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 766 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 808 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 818 aa  70.1  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 934 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  27.36 
 
 		 782 aa  67.4  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.19 
 
 		 894 aa  67  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 805 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.18 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 798 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 		 806 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 767 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  23.78 
 
 		 812 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 866 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  27.75 
 
 		 809 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 821 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  25.84 
 
 		 897 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 795 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 938 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 791 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 725 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 883 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  21.74 
 
 		 818 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 800 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.32 
 
 		 760 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.1 
 
 		 709 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 797 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 1019 aa  49.7  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 814 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.42 
 
 		 797 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2560  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 957 aa  48.1  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.184362  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1023 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 611 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  23.17 
 
 		 942 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  30.51 
 
 		 808 aa  47.4  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  30 
 
 		 767 aa  47.8  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  24.39 
 
 		 931 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 873 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 975 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 771 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 793 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 813 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 730 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0900  hypothetical protein  26.71 
 
 		 1194 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  23.11 
 
 		 1129 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  24.31 
 
 		 799 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 759 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  22.05 
 
 		 988 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 805 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 1080 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 957 aa  44.3  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6796  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 1081 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000906345  hitchhiker  0.0000117399 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 847 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>