93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2584 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  100 
 
 		 926 aa  1849    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  33.26 
 
 		 930 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  29.32 
 
 		 908 aa  321  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.25 
 
 		 921 aa  257  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.89 
 
 		 924 aa  251  5e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.15 
 
 		 952 aa  246  9.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.93 
 
 		 965 aa  229  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  24.32 
 
 		 946 aa  217  7e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.36 
 
 		 920 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  24.41 
 
 		 887 aa  202  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.24 
 
 		 847 aa  190  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.38 
 
 		 904 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  38.82 
 
 		 998 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  42.62 
 
 		 961 aa  185  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.39 
 
 		 929 aa  177  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  23.62 
 
 		 929 aa  146  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  32.31 
 
 		 944 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  30.58 
 
 		 895 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  28.45 
 
 		 872 aa  107  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.27 
 
 		 915 aa  106  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 824 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  28.74 
 
 		 805 aa  95.1  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 829 aa  92  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 832 aa  91.7  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 852 aa  91.3  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  32.8 
 
 		 995 aa  89.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 820 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.76 
 
 		 766 aa  89  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 847 aa  87.8  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  29.18 
 
 		 936 aa  87.8  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  30.21 
 
 		 806 aa  86.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 830 aa  85.9  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 827 aa  85.5  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 813 aa  84.7  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 853 aa  82  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 826 aa  80.5  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 869 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 810 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 814 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 817 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 818 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 821 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 934 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 725 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 822 aa  75.1  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 799 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 973 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 791 aa  73.9  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  28.19 
 
 		 891 aa  72  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 800 aa  72  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  26.56 
 
 		 877 aa  71.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 803 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 808 aa  70.5  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 795 aa  69.7  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 812 aa  68.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 810 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25 
 
 		 805 aa  67.4  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.3 
 
 		 815 aa  67  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 818 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 817 aa  66.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.75 
 
 		 894 aa  64.3  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 813 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 819 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  22.42 
 
 		 812 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 866 aa  61.6  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 802 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 794 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.41 
 
 		 814 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  23.83 
 
 		 709 aa  59.3  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  22.69 
 
 		 804 aa  59.7  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 820 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.03 
 
 		 823 aa  57  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 962 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 611 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.6 
 
 		 772 aa  53.9  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  21.16 
 
 		 705 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.63 
 
 		 879 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  27.87 
 
 		 808 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.2 
 
 		 715 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 		 805 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 1004 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  22.07 
 
 		 893 aa  48.5  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  33.59 
 
 		 409 aa  48.5  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 854 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  25 
 
 		 782 aa  46.6  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 966 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06685  hypothetical protein  30.67 
 
 		 821 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.048704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  22.89 
 
 		 931 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1060 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>