190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1006 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  100 
 
 		 894 aa  1856    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 813 aa  286  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 802 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.15 
 
 		 810 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 852 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 819 aa  258  4e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 		 812 aa  258  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 		 853 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 817 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 829 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 973 aa  246  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  29.3 
 
 		 715 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 934 aa  240  9e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 869 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 832 aa  221  5e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 812 aa  213  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 766 aa  204  5e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 818 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 805 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.15 
 
 		 815 aa  194  7e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 791 aa  188  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 810 aa  187  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 822 aa  184  6e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 830 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 824 aa  181  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 820 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 821 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 827 aa  171  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 808 aa  161  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 813 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 883 aa  157  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 847 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 866 aa  150  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 800 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  22.6 
 
 		 818 aa  144  7e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  23.54 
 
 		 817 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 813 aa  143  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 826 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 828 aa  137  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 814 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 		 820 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.04 
 
 		 897 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 705 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 823 aa  124  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  22.97 
 
 		 725 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 805 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 803 aa  120  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 748 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  22.18 
 
 		 806 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  23.19 
 
 		 709 aa  108  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 611 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 816 aa  104  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  21.28 
 
 		 805 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 795 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 799 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  28.86 
 
 		 814 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.95 
 
 		 924 aa  90.5  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  27.85 
 
 		 946 aa  79.7  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.45 
 
 		 915 aa  77.4  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 793 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  23.64 
 
 		 961 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 998 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 705 aa  74.7  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  28.48 
 
 		 887 aa  67.4  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  24.19 
 
 		 872 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27 
 
 		 904 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.5 
 
 		 833 aa  65.5  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.75 
 
 		 926 aa  64.3  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1063 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.89 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  24.64 
 
 		 929 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  20.26 
 
 		 930 aa  62  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  23.24 
 
 		 895 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 747 aa  61.2  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 		 1085 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  24.61 
 
 		 936 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 998 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.21 
 
 		 921 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  24.69 
 
 		 965 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.92 
 
 		 920 aa  57.8  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  26.82 
 
 		 866 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  28.73 
 
 		 1075 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  21.5 
 
 		 1023 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5340  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 814 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1036 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 791 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  23.95 
 
 		 1188 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 1078 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  24.82 
 
 		 986 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 873 aa  55.5  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1075 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  25.45 
 
 		 847 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  22.61 
 
 		 1021 aa  54.7  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.56 
 
 		 891 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 842 aa  53.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1933  hypothetical protein  30.16 
 
 		 239 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 		 1008 aa  53.1  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  24.4 
 
 		 929 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>