272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1582 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  46.24 
 
 		 832 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 853 aa  1715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  57.66 
 
 		 973 aa  922    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  55.68 
 
 		 869 aa  868    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  55.3 
 
 		 852 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  63.68 
 
 		 934 aa  1054    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  55.42 
 
 		 829 aa  880    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  38.45 
 
 		 802 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 812 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  37.15 
 
 		 813 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 817 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 812 aa  329  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 822 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 830 aa  273  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 810 aa  265  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 810 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  28.26 
 
 		 894 aa  254  4.0000000000000004e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 766 aa  253  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 826 aa  251  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 808 aa  250  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 821 aa  250  8e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 824 aa  246  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 819 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 818 aa  227  7e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 820 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.49 
 
 		 715 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.11 
 
 		 815 aa  222  1.9999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 805 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 866 aa  212  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 791 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 804 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.97 
 
 		 828 aa  198  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 818 aa  196  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.54 
 
 		 814 aa  191  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 827 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 820 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 805 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 847 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 817 aa  174  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 813 aa  173  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 803 aa  167  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 823 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 800 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 795 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 705 aa  151  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 		 799 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 805 aa  144  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 806 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 813 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 883 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 814 aa  123  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  35.27 
 
 		 816 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.93 
 
 		 725 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 794 aa  116  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  32.39 
 
 		 897 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  36.06 
 
 		 793 aa  112  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 998 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.52 
 
 		 961 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.62 
 
 		 709 aa  102  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  29.63 
 
 		 946 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 611 aa  99.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  32.09 
 
 		 965 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  32.45 
 
 		 904 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.08 
 
 		 926 aa  82  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.71 
 
 		 887 aa  80.9  0.00000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  28.46 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23.49 
 
 		 772 aa  77  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.77 
 
 		 872 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  27.87 
 
 		 944 aa  74.7  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.87 
 
 		 924 aa  72.8  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 931 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  32.32 
 
 		 847 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.81 
 
 		 895 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.46 
 
 		 920 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.47 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.21 
 
 		 915 aa  67.4  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.03 
 
 		 930 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 961 aa  66.6  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.64 
 
 		 908 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 748 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 946 aa  65.1  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  28.27 
 
 		 891 aa  64.7  0.000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  25.36 
 
 		 817 aa  64.3  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 760 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  24.21 
 
 		 929 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  26.24 
 
 		 782 aa  61.6  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 757 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3278  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 1006 aa  60.1  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000542759  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 705 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1116 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.19 
 
 		 921 aa  59.7  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.07 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1119 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  45.07 
 
 		 902 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  28.74 
 
 		 942 aa  58.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 		 1014 aa  58.2  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 962 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 962 aa  57.8  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>