92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2180 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  100 
 
 		 782 aa  1596    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 818 aa  131  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 883 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 793 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  22.24 
 
 		 820 aa  127  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 794 aa  122  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.85 
 
 		 820 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 725 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 		 817 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 795 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  22.11 
 
 		 815 aa  104  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  22.86 
 
 		 897 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 748 aa  94.7  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 827 aa  94  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  19.59 
 
 		 816 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 803 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.7 
 
 		 805 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 813 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 705 aa  85.5  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 805 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  22.68 
 
 		 817 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 813 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 791 aa  79.7  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  22.16 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 852 aa  77.8  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 813 aa  77.4  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  27.12 
 
 		 772 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  21.21 
 
 		 806 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  21.29 
 
 		 808 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 829 aa  73.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 823 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 766 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 802 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  21.47 
 
 		 800 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  23.45 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 934 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  27.36 
 
 		 872 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 822 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 810 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  22.46 
 
 		 830 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 818 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 828 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 763 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 812 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 832 aa  62  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  21.14 
 
 		 812 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.24 
 
 		 853 aa  61.6  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 938 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  24.66 
 
 		 846 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 821 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 810 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  36.52 
 
 		 808 aa  57.4  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 998 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 866 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 		 814 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1033 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.96 
 
 		 965 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  21.68 
 
 		 961 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 973 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.48 
 
 		 748 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.79 
 
 		 750 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 819 aa  55.1  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.57 
 
 		 760 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  24.06 
 
 		 952 aa  53.5  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.4 
 
 		 715 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  22.63 
 
 		 887 aa  52.8  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 813 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11443  ferrichrome-iron receptor  25.41 
 
 		 792 aa  50.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.601841  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2474  TonB-dependent receptor plug  26.11 
 
 		 1095 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.840021  normal  0.838838 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1066 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 866 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5755  TonB-dependent siderophore receptor  27.86 
 
 		 793 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  21.85 
 
 		 753 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25 
 
 		 926 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 882 aa  47  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  23.18 
 
 		 946 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  26.02 
 
 		 782 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 		 639 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.63 
 
 		 747 aa  46.6  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 1127 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 917 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 833 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  28.23 
 
 		 791 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2476  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 1095 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.263017  normal  0.39845 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 824 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  20 
 
 		 833 aa  44.7  0.007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  31.25 
 
 		 719 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>