138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2098 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  100 
 
 
794 aa  1583    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  40.18 
 
 
795 aa  566  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 
793 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 
820 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
817 aa  298  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 
725 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.4 
 
 
805 aa  281  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
847 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 
827 aa  252  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 
818 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
813 aa  237  7e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 
805 aa  236  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.28 
 
 
814 aa  233  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  28.88 
 
 
897 aa  221  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  24.17 
 
 
816 aa  221  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.63 
 
 
709 aa  218  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
813 aa  217  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
705 aa  214  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
883 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.08 
 
 
799 aa  193  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 
808 aa  189  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.29 
 
 
806 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  25 
 
 
810 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25 
 
 
821 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 
611 aa  179  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
791 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 
800 aa  158  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 
830 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
748 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
826 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 
813 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
829 aa  152  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.99 
 
 
805 aa  150  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 
824 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 
820 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 
812 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
973 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.84 
 
 
815 aa  144  8e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 
869 aa  141  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
866 aa  140  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
832 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
803 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 
766 aa  134  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 
817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.59 
 
 
782 aa  132  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
705 aa  130  9.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 
810 aa  127  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 
934 aa  127  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 
819 aa  120  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
852 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 
822 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 
853 aa  113  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.82 
 
 
715 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  22.68 
 
 
828 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.11 
 
 
814 aa  89.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
818 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.14 
 
 
804 aa  84  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
812 aa  72.4  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  22.28 
 
 
772 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  23.42 
 
 
823 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 
1076 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  26.01 
 
 
1076 aa  64.7  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.2 
 
 
926 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
962 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
1050 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.43 
 
 
965 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 
971 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2160  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
922 aa  55.5  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000264875  decreased coverage  0.000300576 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  25.33 
 
 
1119 aa  54.3  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  24.09 
 
 
1116 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  26.64 
 
 
1148 aa  54.3  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  24.62 
 
 
1035 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  26.22 
 
 
1155 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.81 
 
 
915 aa  54.3  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  23.4 
 
 
1080 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 
946 aa  53.1  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 
1128 aa  53.1  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 
931 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1300  TonB-dependent receptor plug  26.67 
 
 
1029 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298752  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  26.62 
 
 
808 aa  53.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  23.26 
 
 
1041 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  28.26 
 
 
995 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  23.76 
 
 
1094 aa  52.4  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
1014 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  23.32 
 
 
921 aa  51.6  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4916  TonB-dependent receptor, plug  30.52 
 
 
719 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.526454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0274  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
791 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  25.96 
 
 
1082 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  27.04 
 
 
1012 aa  51.2  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  25.68 
 
 
1031 aa  51.2  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
961 aa  51.2  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  32.46 
 
 
942 aa  50.8  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  25.11 
 
 
1142 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 
1103 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  26.09 
 
 
936 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1998  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
936 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000232712  hitchhiker  0.00000422296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1977  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
936 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00176483  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 
1155 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  23.28 
 
 
971 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>