229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2698 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  44.07 
 
 		 817 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 814 aa  1665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  38.25 
 
 		 827 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 820 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 816 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 847 aa  390  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 813 aa  362  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 818 aa  337  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 805 aa  335  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29.09 
 
 		 820 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 813 aa  294  6e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 805 aa  292  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 897 aa  264  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.09 
 
 		 806 aa  262  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 		 725 aa  257  7e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 611 aa  249  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 795 aa  245  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 883 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 808 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 794 aa  231  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 705 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 813 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 810 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 799 aa  224  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  26.61 
 
 		 709 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 826 aa  217  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 829 aa  217  8e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 824 aa  216  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 821 aa  213  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 805 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 793 aa  211  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.59 
 
 		 800 aa  195  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 802 aa  194  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 791 aa  194  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 822 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.34 
 
 		 766 aa  190  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 866 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 869 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 852 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 934 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  29.07 
 
 		 804 aa  174  6.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.62 
 
 		 815 aa  174  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 818 aa  174  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 832 aa  173  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 973 aa  172  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  26.56 
 
 		 810 aa  171  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 828 aa  167  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 817 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  24.94 
 
 		 812 aa  160  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 819 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.13 
 
 		 894 aa  148  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 803 aa  144  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 748 aa  144  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  35.08 
 
 		 830 aa  142  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.95 
 
 		 715 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.24 
 
 		 814 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 853 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.01 
 
 		 823 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  22.62 
 
 		 772 aa  107  1e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 812 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 998 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  28.91 
 
 		 961 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.87 
 
 		 965 aa  80.1  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  27.66 
 
 		 946 aa  79  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.17 
 
 		 929 aa  77.8  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.71 
 
 		 895 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  24.55 
 
 		 952 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.58 
 
 		 887 aa  67.8  0.0000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 705 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 866 aa  64.7  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2239  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 789 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.01 
 
 		 929 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.68 
 
 		 920 aa  64.3  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  25.26 
 
 		 782 aa  63.5  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1060 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  26.12 
 
 		 1047 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 748 aa  62.8  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25 
 
 		 833 aa  62  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 798 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  26.15 
 
 		 921 aa  61.2  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 946 aa  61.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  25.1 
 
 		 915 aa  60.8  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.41 
 
 		 926 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1036 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 1105 aa  58.2  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  27.16 
 
 		 1058 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 1089 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.8 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.09 
 
 		 904 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 1202 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 757 aa  55.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  24.28 
 
 		 783 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 943 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 767 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 972 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25.57 
 
 		 1066 aa  55.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 918 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  24.67 
 
 		 1094 aa  54.7  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  27.89 
 
 		 627 aa  54.3  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>