143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10578 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  49.83 
 
 		 895 aa  844    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  100 
 
 		 915 aa  1842    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  25.54 
 
 		 961 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.93 
 
 		 891 aa  150  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  32.03 
 
 		 952 aa  147  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  29.65 
 
 		 924 aa  138  4e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.81 
 
 		 887 aa  136  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  32.97 
 
 		 920 aa  130  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  22.22 
 
 		 946 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  28.9 
 
 		 921 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 998 aa  128  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  31.36 
 
 		 944 aa  128  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  28.96 
 
 		 930 aa  126  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  26.59 
 
 		 877 aa  119  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  29.28 
 
 		 929 aa  118  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  40.3 
 
 		 847 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.87 
 
 		 904 aa  111  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  31.69 
 
 		 879 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.66 
 
 		 965 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  30.77 
 
 		 946 aa  106  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.27 
 
 		 926 aa  106  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  26.03 
 
 		 872 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.74 
 
 		 908 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.46 
 
 		 929 aa  93.2  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.89 
 
 		 995 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.31 
 
 		 936 aa  81.6  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 818 aa  81.6  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 826 aa  81.3  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  29.63 
 
 		 815 aa  79  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.45 
 
 		 894 aa  77.4  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 		 804 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 820 aa  75.9  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 800 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 759 aa  70.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 817 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 818 aa  70.5  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 813 aa  68.9  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 822 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 814 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  27.18 
 
 		 809 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  25.21 
 
 		 853 aa  68.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 817 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.52 
 
 		 823 aa  67  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 803 aa  65.9  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 813 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 832 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.26 
 
 		 805 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 824 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26.09 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 829 aa  62.4  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 827 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.78 
 
 		 816 aa  62  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 973 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.75 
 
 		 805 aa  60.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 934 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 847 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 866 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.41 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 802 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 816 aa  59.7  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  30.49 
 
 		 769 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 808 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 821 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 972 aa  56.6  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  30 
 
 		 1122 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 812 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  30 
 
 		 1126 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 795 aa  55.8  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  30 
 
 		 1120 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 806 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 805 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 791 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 883 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  28.33 
 
 		 1066 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1019 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 830 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 793 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 952 aa  52.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.2 
 
 		 725 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.65 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.32 
 
 		 1075 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.58 
 
 		 715 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 897 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 1050 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 791 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 1106 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  23.37 
 
 		 869 aa  50.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  32.35 
 
 		 872 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 794 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  33.9 
 
 		 905 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  31.62 
 
 		 816 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  25.2 
 
 		 1125 aa  49.7  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  26.05 
 
 		 1109 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  21 
 
 		 791 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  23.37 
 
 		 766 aa  49.3  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3233  TonB-dependent siderophore receptor  28.76 
 
 		 907 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000192727  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>