279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0221 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  100 
 
 
830 aa  1697    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 
826 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  33.42 
 
 
821 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 
824 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 
810 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 
822 aa  365  2e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 
808 aa  363  6e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
818 aa  353  7e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  31.27 
 
 
866 aa  350  5e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  30.08 
 
 
815 aa  328  2.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  30.4 
 
 
791 aa  317  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 
829 aa  316  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.25 
 
 
766 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  31.19 
 
 
805 aa  312  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 
817 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 
973 aa  300  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 
847 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 
820 aa  293  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 
832 aa  292  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 
869 aa  290  7e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
813 aa  277  5e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 
803 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.94 
 
 
818 aa  275  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 
817 aa  275  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 
827 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 
853 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
828 aa  271  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
934 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 
705 aa  269  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 
805 aa  269  1e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 
852 aa  267  7e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 
804 aa  266  8.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 
802 aa  257  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 
812 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
812 aa  242  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 
813 aa  231  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.31 
 
 
800 aa  225  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 
816 aa  222  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
819 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 
813 aa  217  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 
810 aa  210  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 
820 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
805 aa  202  3e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  26.93 
 
 
814 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  25.49 
 
 
709 aa  195  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 
725 aa  188  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  25.68 
 
 
894 aa  188  4e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.92 
 
 
823 aa  188  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.92 
 
 
806 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
611 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
793 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
883 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  23.93 
 
 
799 aa  170  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
794 aa  163  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.02 
 
 
715 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 
795 aa  149  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 
814 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  22.56 
 
 
965 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
748 aa  126  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  30.35 
 
 
897 aa  123  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.94 
 
 
961 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 
998 aa  102  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  21.88 
 
 
930 aa  101  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  22.14 
 
 
872 aa  94.4  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  27.27 
 
 
946 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 
705 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  27.85 
 
 
921 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  27.37 
 
 
926 aa  86.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 
933 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
1089 aa  77.4  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.44 
 
 
920 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  25.7 
 
 
929 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.64 
 
 
952 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.42 
 
 
904 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.01 
 
 
924 aa  68.6  0.0000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.91 
 
 
887 aa  68.6  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 
1147 aa  68.6  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 
748 aa  68.6  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  25.68 
 
 
848 aa  68.2  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
897 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 
918 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
874 aa  66.6  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 
753 aa  66.6  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.47 
 
 
760 aa  65.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25 
 
 
908 aa  65.1  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.36 
 
 
782 aa  64.3  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2445  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 
1094 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  31.01 
 
 
792 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 
747 aa  63.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  24.8 
 
 
895 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 
935 aa  62.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
924 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
1066 aa  62  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  25.24 
 
 
833 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  28.37 
 
 
847 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  24 
 
 
957 aa  58.5  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 
1085 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24 
 
 
891 aa  58.2  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 
791 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
1004 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>