127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1493 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  100 
 
 		 891 aa  1825    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.93 
 
 		 915 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  26.65 
 
 		 895 aa  131  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  29.6 
 
 		 887 aa  108  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.99 
 
 		 924 aa  107  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.11 
 
 		 877 aa  107  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  26.84 
 
 		 847 aa  101  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  29.2 
 
 		 879 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  25.56 
 
 		 920 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  28.7 
 
 		 872 aa  93.6  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.39 
 
 		 965 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.08 
 
 		 929 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.76 
 
 		 961 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  25.69 
 
 		 930 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.85 
 
 		 952 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 998 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.94 
 
 		 921 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 810 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.34 
 
 		 908 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  27.94 
 
 		 904 aa  79.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  24.48 
 
 		 929 aa  74.3  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  28.19 
 
 		 926 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 822 aa  71.6  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 		 806 aa  71.2  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 820 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 934 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 818 aa  70.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.56 
 
 		 946 aa  68.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 808 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 869 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 973 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 832 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 852 aa  64.3  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 853 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  26.11 
 
 		 995 aa  63.9  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  24.87 
 
 		 797 aa  63.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.38 
 
 		 823 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  25.32 
 
 		 946 aa  62.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 817 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  27.6 
 
 		 936 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 803 aa  61.2  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 827 aa  61.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 817 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  20.72 
 
 		 944 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 847 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  24.5 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 829 aa  58.5  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 830 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 816 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  22.32 
 
 		 813 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 1003 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 821 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 799 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 766 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 988 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 824 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4736  TonB-dependent receptor plug  33.75 
 
 		 1046 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.399087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  27.35 
 
 		 1087 aa  54.7  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  22.54 
 
 		 805 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1079 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.56 
 
 		 894 aa  53.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 791 aa  53.5  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 1105 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 763 aa  52.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0405  TonB-dependent receptor plug  36.79 
 
 		 1011 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000611509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3978  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 1059 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000935862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 725 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  22.65 
 
 		 812 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  32.56 
 
 		 771 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  24.77 
 
 		 833 aa  51.6  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 897 aa  51.2  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1121  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 919 aa  51.2  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 802 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 962 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1761  TonB-dependent siderophore receptor  26.87 
 
 		 769 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00472024  normal  0.310787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  21.69 
 
 		 812 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0766  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 763 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0590392  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  31.65 
 
 		 1138 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 813 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 982 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.58 
 
 		 1103 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.37 
 
 		 818 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  22.36 
 
 		 866 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 1014 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 		 1089 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 975 aa  49.3  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  33.96 
 
 		 1094 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 814 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  23.97 
 
 		 1008 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  31.15 
 
 		 1064 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 793 aa  48.5  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  23.68 
 
 		 1094 aa  48.1  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 1003 aa  48.5  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  29.87 
 
 		 1074 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  24.29 
 
 		 1137 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 1033 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 1086 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  28.97 
 
 		 1198 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>