78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5407 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 611 aa  1247    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 847 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  37.82 
 
 		 820 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  37.3 
 
 		 827 aa  355  1e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  35.28 
 
 		 817 aa  317  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 725 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 		 816 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 813 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 805 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 813 aa  267  4e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 		 806 aa  258  3e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 897 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  29.76 
 
 		 709 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 805 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 814 aa  239  8e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 818 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 883 aa  228  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 795 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.72 
 
 		 799 aa  203  8e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 824 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 808 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 794 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 866 aa  179  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 810 aa  177  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 820 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 813 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 821 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 748 aa  167  4e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 812 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.22 
 
 		 815 aa  157  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.22 
 
 		 805 aa  155  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 818 aa  153  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 793 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 822 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 826 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 766 aa  146  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 803 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 817 aa  142  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  26.3 
 
 		 828 aa  137  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 802 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 812 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 832 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 705 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 819 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.44 
 
 		 800 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 804 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.14 
 
 		 810 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 973 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  24.18 
 
 		 715 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 829 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.46 
 
 		 894 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 791 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 869 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 934 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 853 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 852 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 814 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  37.59 
 
 		 830 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  25.96 
 
 		 772 aa  67.4  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 823 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 917 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.55 
 
 		 926 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1508  TonB-dependent receptor  44.07 
 
 		 958 aa  51.2  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000651564  unclonable  0.0000000259897 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 946 aa  51.2  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  26.04 
 
 		 936 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3520  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 957 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 932 aa  48.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  23.17 
 
 		 872 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04960  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 842 aa  47  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.143885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1557  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 853 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3041  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 931 aa  47  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  unclonable  0.00000614421  normal  0.287923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 998 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4064  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 836 aa  46.2  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.200466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  27.05 
 
 		 838 aa  45.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02398  putative tonB-dependent receptor  25 
 
 		 901 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.835744  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0224  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 918 aa  43.9  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000414921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 920 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>