72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4518 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 705 aa  1418    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 748 aa  201  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 820 aa  134  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 813 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 794 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  24.43 
 
 		 725 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 805 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 705 aa  123  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.75 
 
 		 805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.79 
 
 		 806 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 847 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 611 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  21.44 
 
 		 820 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 		 827 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.08 
 
 		 772 aa  101  5e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 813 aa  100  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 810 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  21.75 
 
 		 816 aa  98.6  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 795 aa  95.5  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  21.57 
 
 		 799 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  22.73 
 
 		 883 aa  94  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 791 aa  91.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 822 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 817 aa  88.6  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 817 aa  87.8  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 808 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 824 aa  87  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  21.99 
 
 		 830 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  20.9 
 
 		 709 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 812 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  25.51 
 
 		 818 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 869 aa  76.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.82 
 
 		 894 aa  75.5  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  22.44 
 
 		 805 aa  75.5  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  24.95 
 
 		 804 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 812 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 813 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.06 
 
 		 832 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 826 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  21.09 
 
 		 866 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 973 aa  70.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  24.35 
 
 		 815 aa  69.3  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 766 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 934 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.51 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 814 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 819 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 793 aa  60.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 818 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 853 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 920 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4504  TonB-dependent receptor plug  26.13 
 
 		 1074 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.342548  normal  0.477441 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  21.93 
 
 		 715 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  22.62 
 
 		 1085 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  34.06 
 
 		 1039 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 821 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5752  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 746 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0523831  hitchhiker  0.0000000000276247 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 800 aa  47.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 852 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25 
 
 		 952 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 		 1058 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1127 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5532  TonB-dependent receptor plug  31.21 
 
 		 1092 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0182385  normal  0.924407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 641 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1070  TonB-dependent receptor  23.33 
 
 		 991 aa  45.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  27.12 
 
 		 1049 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 938 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00241  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 885 aa  44.7  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0251  hypothetical protein  24.29 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.614508  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 1028 aa  43.9  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.87 
 
 		 921 aa  43.9  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>