102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2379 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  100 
 
 		 921 aa  1880    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  52.44 
 
 		 952 aa  950    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.82 
 
 		 998 aa  442  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  32.43 
 
 		 961 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  30.65 
 
 		 946 aa  378  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  29.24 
 
 		 930 aa  314  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  29.49 
 
 		 965 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.9 
 
 		 929 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.97 
 
 		 924 aa  295  4e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.97 
 
 		 887 aa  286  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  27.54 
 
 		 847 aa  266  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.25 
 
 		 926 aa  254  6e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.7 
 
 		 904 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.19 
 
 		 920 aa  232  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.52 
 
 		 908 aa  226  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  26.17 
 
 		 929 aa  213  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  23.44 
 
 		 936 aa  164  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  24.18 
 
 		 944 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.4 
 
 		 895 aa  135  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  30.08 
 
 		 946 aa  130  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  28.9 
 
 		 915 aa  129  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  30.77 
 
 		 995 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  28.2 
 
 		 877 aa  100  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 826 aa  95.1  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  23.14 
 
 		 872 aa  91.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  29.79 
 
 		 879 aa  90.9  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 822 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 830 aa  87.8  8e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  25.94 
 
 		 891 aa  83.6  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.19 
 
 		 766 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 829 aa  82  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.51 
 
 		 804 aa  81.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 800 aa  81.3  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 818 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.31 
 
 		 815 aa  80.1  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 818 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 813 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 824 aa  75.5  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.71 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 813 aa  73.9  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 		 799 aa  73.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 810 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.07 
 
 		 806 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 808 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 820 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 816 aa  72.8  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 817 aa  70.9  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 821 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 869 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 832 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.9 
 
 		 805 aa  65.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 813 aa  65.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 705 aa  65.5  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 802 aa  65.5  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 866 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 819 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 817 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  23.44 
 
 		 810 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 814 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 814 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.21 
 
 		 894 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 		 805 aa  59.7  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 853 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 791 aa  58.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  26.29 
 
 		 812 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 812 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 725 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 973 aa  55.8  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.09 
 
 		 715 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 934 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 803 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0369  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 1234 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  22.49 
 
 		 820 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 962 aa  52.4  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  21.63 
 
 		 897 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 972 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  21.55 
 
 		 823 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 794 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 833 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  24.21 
 
 		 800 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4510  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  28.28 
 
 		 867 aa  50.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 946 aa  50.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 747 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1105  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor:TonB-dependent haem/haemoglobin receptor  32.59 
 
 		 859 aa  49.3  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 1014 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 866 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2426  TonB-dependent receptor, plug  26.26 
 
 		 652 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000164352  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 1129 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 883 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1284  TonB-dependent outer membrane heme receptor  31.85 
 
 		 857 aa  46.2  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2844  TonB-dependent siderophore receptor  29.81 
 
 		 782 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.350592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  24.09 
 
 		 709 aa  46.2  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 818 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 882 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.86 
 
 		 862 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>