83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2270 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  100 
 
 		 929 aa  1862    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  44.24 
 
 		 965 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  32.52 
 
 		 998 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  32.02 
 
 		 946 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.78 
 
 		 961 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  30.62 
 
 		 847 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  28.14 
 
 		 921 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  29.31 
 
 		 952 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  27.95 
 
 		 930 aa  284  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.94 
 
 		 920 aa  263  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.69 
 
 		 929 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.16 
 
 		 887 aa  258  5e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  26.97 
 
 		 908 aa  243  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  25.66 
 
 		 904 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.79 
 
 		 924 aa  220  1e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  25.26 
 
 		 926 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  22.68 
 
 		 946 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  30.71 
 
 		 872 aa  124  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  30.28 
 
 		 995 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  31.45 
 
 		 936 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  27.66 
 
 		 895 aa  97.4  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  27.46 
 
 		 915 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 847 aa  88.2  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  26.98 
 
 		 877 aa  82  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 813 aa  81.3  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 817 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 818 aa  79.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 827 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 814 aa  77.4  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  24.46 
 
 		 804 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  26.83 
 
 		 766 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 820 aa  75.1  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  23.51 
 
 		 891 aa  74.3  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  22.58 
 
 		 829 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.43 
 
 		 814 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 830 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 816 aa  70.1  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  28.16 
 
 		 944 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 822 aa  69.3  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 820 aa  69.3  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  22.39 
 
 		 828 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 821 aa  68.2  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 		 802 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 826 aa  66.2  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  22.41 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.5 
 
 		 810 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 852 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  24.21 
 
 		 853 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 817 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 824 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  24.64 
 
 		 894 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 813 aa  62  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 805 aa  61.6  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 973 aa  61.2  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 832 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 725 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 812 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  22 
 
 		 869 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  23.2 
 
 		 934 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 		 818 aa  59.7  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 808 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  23.61 
 
 		 806 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 		 812 aa  58.9  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  21.22 
 
 		 805 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.74 
 
 		 879 aa  58.2  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 866 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 803 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 		 823 aa  56.6  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 938 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 791 aa  54.7  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 795 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  23.76 
 
 		 750 aa  53.1  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 793 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  21.92 
 
 		 805 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 1094 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 957 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 1147 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  26.19 
 
 		 1062 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 962 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.1 
 
 		 1075 aa  45.4  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 819 aa  44.3  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>