155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2963 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 897 aa  1817    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 805 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 820 aa  348  2e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  30.62 
 
 		 818 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 847 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 883 aa  323  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 817 aa  312  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  29.66 
 
 		 816 aa  283  1e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 813 aa  280  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 813 aa  273  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  29.15 
 
 		 709 aa  271  4e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  30.83 
 
 		 611 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  27.73 
 
 		 814 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 725 aa  241  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 810 aa  240  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 805 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 705 aa  225  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 817 aa  217  7e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.31 
 
 		 806 aa  210  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  26.02 
 
 		 820 aa  206  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 799 aa  198  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 795 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 802 aa  190  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 821 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 793 aa  187  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 829 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 869 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  23.26 
 
 		 805 aa  178  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 822 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 973 aa  169  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 826 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 791 aa  167  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 800 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 832 aa  163  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  25.82 
 
 		 810 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 824 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 866 aa  155  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.34 
 
 		 815 aa  154  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  24.78 
 
 		 828 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 748 aa  147  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 852 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 804 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.04 
 
 		 894 aa  134  1.0000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 830 aa  124  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  22.68 
 
 		 715 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  24.19 
 
 		 823 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  34.56 
 
 		 813 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 853 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  30.74 
 
 		 808 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 814 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 812 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 766 aa  106  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  22.86 
 
 		 782 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 818 aa  98.6  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 812 aa  97.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 819 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.25 
 
 		 772 aa  80.1  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  27.11 
 
 		 1101 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 705 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 1116 aa  70.9  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4497  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1198 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0452901  normal  0.421044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  25.34 
 
 		 952 aa  66.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3802  TonB-dependent receptor, plug  24.93 
 
 		 1211 aa  64.7  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 1148 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4176  TonB-dependent receptor plug  24.7 
 
 		 1086 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.83694  normal  0.0436959 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 1128 aa  61.2  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  23.22 
 
 		 887 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1176 aa  60.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  23.89 
 
 		 1219 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 934 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  22.36 
 
 		 1148 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1113 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  24.04 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6155  TonB-dependent receptor plug  21.37 
 
 		 1229 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.597613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  27.39 
 
 		 961 aa  57.8  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  23.46 
 
 		 1127 aa  57.4  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1168 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3242  TonB-dependent receptor, putative  29.75 
 
 		 838 aa  57  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  23.84 
 
 		 1102 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  24.4 
 
 		 1114 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 917 aa  56.2  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 1166 aa  55.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  22.49 
 
 		 1155 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3048  TonB-dependent receptor plug  25.4 
 
 		 1220 aa  55.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  21.65 
 
 		 1150 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  23.38 
 
 		 1103 aa  54.7  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2641  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 1123 aa  54.3  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42355  normal  0.497616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  28.06 
 
 		 929 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6740  TonB-dependent receptor plug  24.1 
 
 		 1116 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 1127 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.84 
 
 		 872 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0532  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 936 aa  53.5  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0904706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  23.1 
 
 		 1160 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  21.58 
 
 		 1144 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  21.63 
 
 		 921 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 998 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  23.83 
 
 		 915 aa  52  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>