More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4884 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 800 aa  1645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 821 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 808 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 810 aa  266  8e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 820 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 827 aa  256  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 817 aa  250  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 791 aa  243  7e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  27.32 
 
 		 815 aa  231  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 805 aa  227  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 866 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 824 aa  223  8e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 830 aa  223  9e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.27 
 
 		 818 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 803 aa  218  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 822 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 828 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 847 aa  210  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.38 
 
 		 805 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.63 
 
 		 816 aa  198  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 829 aa  193  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 814 aa  191  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 826 aa  188  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.07 
 
 		 814 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 852 aa  184  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 705 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 802 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 813 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 823 aa  180  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  26.34 
 
 		 709 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 869 aa  175  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 973 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 805 aa  174  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 897 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 813 aa  161  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 934 aa  160  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  24.55 
 
 		 820 aa  159  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 794 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 832 aa  154  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 853 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  22.62 
 
 		 894 aa  144  7e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  23.72 
 
 		 804 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  24.16 
 
 		 799 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 812 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 818 aa  137  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 817 aa  133  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  24.47 
 
 		 812 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  25.32 
 
 		 715 aa  132  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 766 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 883 aa  127  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 793 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  32.68 
 
 		 961 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 611 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 813 aa  108  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 748 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 998 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 795 aa  103  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 		 819 aa  103  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 810 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 806 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 725 aa  92  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26 
 
 		 946 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  29.88 
 
 		 952 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  32.31 
 
 		 908 aa  84.7  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  29.11 
 
 		 887 aa  82.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  26.85 
 
 		 930 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  30.88 
 
 		 921 aa  81.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 933 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 938 aa  77.4  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  30.17 
 
 		 904 aa  74.7  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  27.95 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  29.03 
 
 		 926 aa  72  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  28.91 
 
 		 915 aa  72  0.00000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 962 aa  71.2  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  21.47 
 
 		 782 aa  70.5  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  25.9 
 
 		 965 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  26.28 
 
 		 944 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 943 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  28.47 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 759 aa  65.9  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  22.41 
 
 		 929 aa  65.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 893 aa  63.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 947 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  27.11 
 
 		 920 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 946 aa  63.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  41.24 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  25.81 
 
 		 1019 aa  62.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 814 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 902 aa  60.8  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 1060 aa  60.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 791 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.69 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3121  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 809 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.59 
 
 		 929 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  24.8 
 
 		 1085 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 678 aa  59.3  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.47 
 
 		 750 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  36.04 
 
 		 623 aa  59.3  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>