More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3193 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 766 aa  1560    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 829 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 802 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 810 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 821 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 808 aa  316  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 813 aa  316  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 817 aa  315  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 830 aa  312  2e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 822 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 869 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 973 aa  289  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  28.02 
 
 		 815 aa  288  2.9999999999999996e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  30.22 
 
 		 812 aa  287  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 826 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 832 aa  284  4.0000000000000003e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 934 aa  277  7e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 818 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 820 aa  265  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.03 
 
 		 853 aa  261  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 852 aa  261  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 824 aa  258  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 805 aa  253  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  30.49 
 
 		 847 aa  244  5e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 819 aa  231  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  26.42 
 
 		 804 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  28.21 
 
 		 715 aa  228  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 812 aa  227  8e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.93 
 
 		 810 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 827 aa  221  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 818 aa  221  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 828 aa  220  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 817 aa  219  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 813 aa  213  1e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 813 aa  212  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 866 aa  210  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  26.1 
 
 		 894 aa  206  1e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 791 aa  201  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 705 aa  201  6e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  26.91 
 
 		 805 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  25.7 
 
 		 820 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 725 aa  191  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  23.98 
 
 		 814 aa  188  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 883 aa  184  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 816 aa  182  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 800 aa  180  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  25.32 
 
 		 799 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 		 823 aa  177  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.53 
 
 		 806 aa  168  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 805 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 897 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 795 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 793 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.6 
 
 		 814 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 611 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  23.89 
 
 		 709 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 794 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  24.34 
 
 		 748 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 998 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  30.52 
 
 		 961 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.71 
 
 		 920 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  24.75 
 
 		 926 aa  94.7  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  26.43 
 
 		 946 aa  88.2  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  29.33 
 
 		 952 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  29.19 
 
 		 921 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  25.24 
 
 		 930 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  23.94 
 
 		 965 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  23 
 
 		 772 aa  79  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  29.73 
 
 		 904 aa  77.4  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.98 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  27.57 
 
 		 929 aa  75.5  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.52 
 
 		 705 aa  73.6  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.52 
 
 		 924 aa  72.4  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  24.36 
 
 		 887 aa  71.2  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.98 
 
 		 929 aa  70.9  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  28.11 
 
 		 872 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  22.06 
 
 		 908 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0558  TonB-dependent receptor plug  24.05 
 
 		 817 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000727933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  26.73 
 
 		 797 aa  61.6  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  28.12 
 
 		 760 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0763  TonB-dependent receptor plug  25.8 
 
 		 783 aa  60.1  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.945699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  24.28 
 
 		 847 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2735  TonB-dependent receptor, plug  30.28 
 
 		 650 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 798 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 		 753 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0123  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.96 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000105264  normal  0.11479 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  27.69 
 
 		 848 aa  58.2  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  30.8 
 
 		 988 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  25.93 
 
 		 747 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 1089 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  27.81 
 
 		 944 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0089  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 957 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4228  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 931 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5439  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 962 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.648524  normal  0.961509 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  31.67 
 
 		 936 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3075  outer membrane receptor FepA  25.37 
 
 		 724 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0667  outer membrane receptor FepA  30 
 
 		 746 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0602  outer membrane receptor FepA  30 
 
 		 746 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>