242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3424 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 847 aa  1732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 820 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  38.71 
 
 		 827 aa  562  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  33.21 
 
 		 816 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 818 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5407  TonB-dependent receptor  38.12 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000690953  normal  0.146113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 813 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  32.44 
 
 		 814 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 725 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  31.55 
 
 		 813 aa  361  4e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 805 aa  350  8e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  31.9 
 
 		 805 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3391  outer membrane receptor protein mostly Fe transport  32.23 
 
 		 709 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146239  normal  0.880132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  29.89 
 
 		 806 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  32.37 
 
 		 705 aa  340  4e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  31.05 
 
 		 897 aa  323  9.000000000000001e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 795 aa  319  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  29.77 
 
 		 799 aa  317  4e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 883 aa  301  4e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  29.04 
 
 		 820 aa  299  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 830 aa  296  1e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 810 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 794 aa  271  4e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 824 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 808 aa  268  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 821 aa  265  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 805 aa  263  8e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 818 aa  257  6e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3970  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 793 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 826 aa  239  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 		 766 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 803 aa  228  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 813 aa  227  6e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 822 aa  226  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 866 aa  224  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 829 aa  218  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 802 aa  213  9e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  25.71 
 
 		 828 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  25.65 
 
 		 800 aa  210  8e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 817 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 832 aa  203  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 869 aa  202  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  25.66 
 
 		 815 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 812 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  29.12 
 
 		 812 aa  197  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 819 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 791 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0536  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 748 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 934 aa  176  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 852 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 973 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  25.04 
 
 		 804 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 		 853 aa  172  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.8 
 
 		 894 aa  152  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 814 aa  150  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  25.49 
 
 		 823 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  24.66 
 
 		 772 aa  128  4.0000000000000003e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  23.47 
 
 		 782 aa  127  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 705 aa  117  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  27.84 
 
 		 810 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  26.57 
 
 		 961 aa  98.2  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.01 
 
 		 929 aa  89  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.06 
 
 		 926 aa  87.8  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  30.08 
 
 		 904 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 998 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  32.28 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  25.9 
 
 		 946 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  26.28 
 
 		 965 aa  81.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.45 
 
 		 887 aa  80.5  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  26.64 
 
 		 924 aa  80.5  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  24.5 
 
 		 930 aa  79.7  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  26.56 
 
 		 952 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  25.28 
 
 		 944 aa  77.8  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  24.89 
 
 		 920 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  25 
 
 		 929 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  25.33 
 
 		 921 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1147 aa  68.2  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  29.35 
 
 		 848 aa  67.8  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  25.53 
 
 		 753 aa  65.1  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 798 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  25.2 
 
 		 750 aa  63.9  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 778 aa  64.3  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.26 
 
 		 833 aa  63.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 933 aa  63.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  23.27 
 
 		 760 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 946 aa  62  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 757 aa  60.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  21.92 
 
 		 915 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  28.4 
 
 		 812 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24.53 
 
 		 891 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  25.89 
 
 		 908 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  26.73 
 
 		 1064 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  22.76 
 
 		 995 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 943 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  28.96 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6376  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 920 aa  58.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 1166 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 962 aa  57.4  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2533  TonB-dependent receptor  39.45 
 
 		 800 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>