105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3443 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  52.44 
 
 		 921 aa  951    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 952 aa  1924    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 998 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  31.64 
 
 		 961 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  30.23 
 
 		 946 aa  357  5.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  29.6 
 
 		 930 aa  317  8e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  28.84 
 
 		 929 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  27.86 
 
 		 965 aa  291  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  28.49 
 
 		 847 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  26.47 
 
 		 887 aa  254  8.000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.21 
 
 		 926 aa  246  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  28.14 
 
 		 904 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  27.23 
 
 		 908 aa  238  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.62 
 
 		 929 aa  235  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  26.82 
 
 		 920 aa  215  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  33.63 
 
 		 924 aa  211  5e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  32.53 
 
 		 872 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  32.4 
 
 		 915 aa  151  7e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  32.2 
 
 		 895 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  23.64 
 
 		 946 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  33.98 
 
 		 995 aa  138  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  30.15 
 
 		 944 aa  136  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  31.52 
 
 		 936 aa  128  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  32.79 
 
 		 877 aa  121  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 818 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  31.22 
 
 		 826 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  27.78 
 
 		 804 aa  96.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 824 aa  94  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  32.86 
 
 		 813 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  26.06 
 
 		 891 aa  92.8  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  26.72 
 
 		 879 aa  93.2  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5196  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 829 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.283017  normal  0.121855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 800 aa  90.9  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3236  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 808 aa  90.1  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.833355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2699  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 817 aa  88.6  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6217  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 820 aa  88.2  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 822 aa  87.4  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 821 aa  87.4  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 810 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3193  TonB-dependent receptor plug  29.33 
 
 		 766 aa  85.9  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.646105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 847 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 799 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0346  TonB-dependent receptor plug  24.6 
 
 		 805 aa  83.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.684844  normal  0.0398868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 817 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 813 aa  82.4  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6378  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00914349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2981  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 816 aa  81.6  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 852 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6739  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 832 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.616271  normal  0.465298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 869 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  28.46 
 
 		 853 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09223  TonB-dependent receptor, putative  26.52 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 830 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 934 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3170  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 827 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 802 aa  75.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 819 aa  75.1  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  24.64 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  26.54 
 
 		 806 aa  72  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4726  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 		 803 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3536  TonB-dependent receptor plug  27.03 
 
 		 812 aa  70.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0256  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.655297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  28.57 
 
 		 818 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5599  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000158529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2698  TonB-dependent receptor plug  23.29 
 
 		 814 aa  69.3  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2963  TonB-dependent receptor plug  24.92 
 
 		 897 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300449  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  27.61 
 
 		 894 aa  68.2  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 973 aa  67.4  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2492  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 795 aa  66.2  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  27.96 
 
 		 814 aa  65.1  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1267  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 805 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0311694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0116  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 823 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.797457  normal  0.0887465 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 812 aa  61.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4086  TonB-dependent receptor plug  23.48 
 
 		 820 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0127812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  24.72 
 
 		 810 aa  60.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0796  hypothetical protein  28.57 
 
 		 772 aa  60.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1515  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 705 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.98093  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0102  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.436886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2740  TonB-dependent receptor plug  26.39 
 
 		 725 aa  59.3  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2180  hypothetical protein  24.23 
 
 		 782 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3096  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 883 aa  56.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.10953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 833 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2626  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  27.71 
 
 		 715 aa  53.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.33425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 972 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 812 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  22.05 
 
 		 791 aa  51.2  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1109 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.22 
 
 		 785 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07040  ferrichrome-iron receptor  29.41 
 
 		 808 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  30.97 
 
 		 1129 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 793 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  27.69 
 
 		 800 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4518  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 705 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 836 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 1075 aa  47.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2098  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 794 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.761399  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 917 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 1149 aa  45.8  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 866 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 932 aa  45.8  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>