80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0441 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0441  hypothetical protein  100 
 
 
877 aa  1813    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1654  hypothetical protein  25.14 
 
 
879 aa  203  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648752  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10578  hypothetical protein  26.59 
 
 
915 aa  119  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.392635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3443  hypothetical protein  33.18 
 
 
952 aa  118  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1485  hypothetical protein  30.65 
 
 
895 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0095  hypothetical protein  28.52 
 
 
944 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0167814  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  28.11 
 
 
891 aa  107  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2379  hypothetical protein  28.2 
 
 
921 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5348  hypothetical protein  28.23 
 
 
946 aa  98.2  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1136  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
998 aa  97.4  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.028233  normal  0.759049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03085  hypothetical protein  25.5 
 
 
924 aa  96.7  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882894  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5762  hypothetical protein  28.85 
 
 
965 aa  91.3  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  25.19 
 
 
961 aa  89.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0205  hypothetical protein  27.59 
 
 
930 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.210735 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0733  hypothetical protein  26.92 
 
 
904 aa  88.6  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4088  hypothetical protein  30.65 
 
 
847 aa  83.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715502 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2270  hypothetical protein  26.98 
 
 
929 aa  82.4  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0241  hypothetical protein  27.27 
 
 
929 aa  81.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0416678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1880  hypothetical protein  22.75 
 
 
920 aa  77.4  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6640  hypothetical protein  28.49 
 
 
946 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312717  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2202  hypothetical protein  25.98 
 
 
872 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.898839  hitchhiker  0.0000000204657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2584  hypothetical protein  26.56 
 
 
926 aa  71.6  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.323052  normal  0.265899 
 
 
-
 
NC_002950  PG1715  hypothetical protein  25.31 
 
 
887 aa  70.9  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3654  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 
810 aa  68.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1397  hypothetical protein  24.89 
 
 
995 aa  67.8  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0243953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5164  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
813 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2796  hypothetical protein  25 
 
 
936 aa  64.3  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 
763 aa  58.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2458  hypothetical protein  23.71 
 
 
908 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5882  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 
826 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.431765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3424  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
847 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.052799  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0332  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 
869 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879303  normal  0.710919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  25.46 
 
 
1075 aa  54.7  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.31 
 
 
1039 aa  54.3  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1863  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 
818 aa  54.3  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38733  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 
854 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0823  TonB-dependent receptor  23.81 
 
 
817 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173477  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5200  TonB-dependent receptor plug  27.24 
 
 
818 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.441429  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3278  TonB-dependent receptor  25 
 
 
973 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2872  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 
934 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.15635  normal  0.94613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1938  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 
801 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17436  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  30.6 
 
 
1094 aa  52  0.00006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4856  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
819 aa  51.6  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.163752 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3169  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
813 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5304  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 
812 aa  51.2  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.144104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3601  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
1090 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000169408  hitchhiker  0.00028286 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  27.04 
 
 
1032 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4785  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 
822 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 
1101 aa  50.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0221  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 
830 aa  50.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.280275  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
998 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0150  hypothetical protein  31.35 
 
 
822 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4493  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
791 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.294289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
760 aa  48.9  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 
775 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1455  TonB-dependent receptor plug  23.11 
 
 
814 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.749595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 
971 aa  47.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1282  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 
852 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0691192  normal  0.241515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4830  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 
771 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2201  TonB-dependent receptor  32 
 
 
893 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  19.83 
 
 
805 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  31.58 
 
 
839 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 
1036 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1438  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 
999 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.226679 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 
972 aa  47  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 
958 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0967  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 
1093 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 
962 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  24.89 
 
 
806 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 
718 aa  45.8  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
1050 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 
1066 aa  45.8  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 
1237 aa  45.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1467  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
802 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148814  normal  0.0599921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2514  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 
821 aa  45.1  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  26.28 
 
 
1051 aa  45.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2598  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 
777 aa  44.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1414  hypothetical protein  30.61 
 
 
871 aa  44.7  0.008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.530363 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0220  TonB-dependent receptor plug  22.48 
 
 
804 aa  44.3  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.831409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5130  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
810 aa  44.3  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>