200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2647 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  41.11 
 
 		 853 aa  691    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  45.31 
 
 		 843 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  100 
 
 		 839 aa  1722    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  42.6 
 
 		 857 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  28.34 
 
 		 853 aa  353  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  29.02 
 
 		 855 aa  350  7e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  28.79 
 
 		 828 aa  341  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  28.78 
 
 		 848 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  27.87 
 
 		 856 aa  319  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  29.05 
 
 		 841 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  26.08 
 
 		 838 aa  225  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  24.27 
 
 		 877 aa  215  2.9999999999999995e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  23.51 
 
 		 831 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  24.36 
 
 		 828 aa  164  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  23.62 
 
 		 814 aa  148  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  21.8 
 
 		 811 aa  134  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  24.16 
 
 		 816 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  23.12 
 
 		 849 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  23.27 
 
 		 829 aa  131  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  24.1 
 
 		 905 aa  71.6  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  38.2 
 
 		 993 aa  68.9  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  39.77 
 
 		 1173 aa  68.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1182 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  24.19 
 
 		 930 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1048 aa  66.6  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  40.86 
 
 		 1104 aa  65.1  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  37.27 
 
 		 1089 aa  64.3  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  36.56 
 
 		 1051 aa  63.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  28.76 
 
 		 425 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 		 1028 aa  62.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1064 aa  60.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  20.8 
 
 		 925 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  26.9 
 
 		 1006 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 790 aa  57.8  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  22.63 
 
 		 854 aa  57.8  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.45 
 
 		 957 aa  57.4  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05065  hypothetical protein  35.19 
 
 		 979 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 759 aa  56.6  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4523  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 998 aa  57  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0414328  normal  0.0764127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  37.08 
 
 		 1237 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  36.04 
 
 		 1038 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 		 952 aa  56.2  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1050 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.04 
 
 		 1059 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6636  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 992 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.300178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  31.58 
 
 		 381 aa  55.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  34.48 
 
 		 1025 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 933 aa  55.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1107 aa  55.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 935 aa  55.1  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1066 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4814  TonB-dependent receptor, plug  34.29 
 
 		 1095 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  35.23 
 
 		 1016 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  36.28 
 
 		 1021 aa  53.5  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  34.02 
 
 		 966 aa  53.9  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 		 1043 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  34.41 
 
 		 1005 aa  52.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  35.56 
 
 		 1011 aa  53.1  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  34.83 
 
 		 1071 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0615  TonB-dependent receptor plug  32.95 
 
 		 1098 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6729  TonB-dependent receptor plug  31.19 
 
 		 1036 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  30.28 
 
 		 1062 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7177  TonB-dependent receptor plug  36.19 
 
 		 971 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 1090 aa  52.8  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  32.22 
 
 		 1009 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4416  TonB-dependent receptor plug  30.23 
 
 		 996 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000494503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3591  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 730 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.765405  normal  0.0684866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 		 1006 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 972 aa  52  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1023 aa  51.6  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 		 1063 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 1082 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  34.38 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.63 
 
 		 1161 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  30.53 
 
 		 1036 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 1002 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1027 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  36.26 
 
 		 828 aa  50.4  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  28.18 
 
 		 914 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 		 753 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  35.71 
 
 		 1019 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 		 1023 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  34.82 
 
 		 1137 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5549  TonB-dependent receptor plug  31.53 
 
 		 1036 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604752  normal  0.603269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 888 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  26.21 
 
 		 1085 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  31.4 
 
 		 1102 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 824 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1163 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  45.45 
 
 		 1001 aa  49.7  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  32.56 
 
 		 984 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  36.36 
 
 		 1024 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 922 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.29 
 
 		 942 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3035  TonB-dependent receptor, plug  34 
 
 		 1007 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3993  TonB-dependent receptor plug  34.09 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.356607  hitchhiker  0.00078443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0915  TonB-dependent receptor plug  33.68 
 
 		 1075 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0816  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 816 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  35.71 
 
 		 986 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 1034 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>