152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3158 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  42.22 
 
 		 839 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  100 
 
 		 857 aa  1761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  38.53 
 
 		 843 aa  584  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  36.89 
 
 		 853 aa  561  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  27.66 
 
 		 828 aa  317  5e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  28.02 
 
 		 841 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  28.08 
 
 		 848 aa  281  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  26.41 
 
 		 856 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  24.97 
 
 		 853 aa  248  4e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  28.41 
 
 		 838 aa  238  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  25.77 
 
 		 877 aa  201  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  27.42 
 
 		 855 aa  179  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  24.09 
 
 		 831 aa  159  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  23.85 
 
 		 828 aa  154  8e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  21.42 
 
 		 829 aa  114  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  23.22 
 
 		 814 aa  102  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  23.4 
 
 		 816 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  23.56 
 
 		 811 aa  95.1  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3734  hypothetical protein  22.11 
 
 		 849 aa  94.7  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  24.27 
 
 		 925 aa  80.1  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  39.06 
 
 		 1182 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 824 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  38.05 
 
 		 1081 aa  60.1  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  37.61 
 
 		 1059 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 1083 aa  57.8  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  32.33 
 
 		 1192 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2553  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 775 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.826043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  25.69 
 
 		 905 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0454  TonB-dependent receptor plug  32.32 
 
 		 1006 aa  55.1  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0605614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  34.51 
 
 		 1063 aa  54.7  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 1023 aa  54.3  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  36.05 
 
 		 776 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 		 1077 aa  53.9  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0080  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1040 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  27.84 
 
 		 1874 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  35.34 
 
 		 381 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1027 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1059 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5213  TonB-dependent receptor plug  36.26 
 
 		 831 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  33.7 
 
 		 1119 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  33.96 
 
 		 1066 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 1096 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  35.45 
 
 		 1062 aa  52  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3040  TonB-dependent receptor plug  34.58 
 
 		 1107 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0955373 
 
 
-
 
NC_002950  PG0534  hypothetical protein  32.59 
 
 		 827 aa  51.6  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.993491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0637  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.87 
 
 		 957 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 		 1078 aa  51.6  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  39.29 
 
 		 1016 aa  51.2  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  31.36 
 
 		 1008 aa  51.2  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  40.66 
 
 		 1021 aa  50.8  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1924  TonB-dependent receptor, plug  33.96 
 
 		 1035 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3079  hypothetical protein  30.3 
 
 		 930 aa  50.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0337116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1266  hypothetical protein  26.09 
 
 		 250 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0545  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 922 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1368  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 962 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  33.59 
 
 		 1111 aa  50.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  38.18 
 
 		 1047 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4225  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1041 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.501222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3310  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 971 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.183606 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4139  TonB-dependent receptor plug  42.17 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.380719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1082 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6201  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 792 aa  50.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180882  normal  0.205128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05670  outer membrane protein  33.61 
 
 		 1025 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 1060 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 1020 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0696  hypothetical protein  33.33 
 
 		 961 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  32.43 
 
 		 1028 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  34.21 
 
 		 1101 aa  48.9  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.51 
 
 		 989 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2272  TonB-dependent receptor  35.14 
 
 		 814 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2695  hypothetical protein  26.67 
 
 		 854 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.579466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 947 aa  48.9  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1555  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1104 aa  48.1  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.10988 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  37.65 
 
 		 986 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  33.93 
 
 		 1005 aa  48.1  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.03 
 
 		 1114 aa  48.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1582  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 853 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00843923  normal  0.229135 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  34.41 
 
 		 800 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  34.85 
 
 		 767 aa  47.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4500  TonB-dependent receptor, plug  31.76 
 
 		 1058 aa  47.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0187  von Willebrand factor type A  37.97 
 
 		 613 aa  47.8  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.592381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 1089 aa  47.8  0.0009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4559  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 1033 aa  47.8  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00904545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 793 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 952 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 966 aa  47  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2810  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 		 1048 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.348829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3036  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1033 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000276569  normal  0.556141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  33.64 
 
 		 933 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  29.27 
 
 		 833 aa  46.2  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  33.7 
 
 		 759 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 769 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1596  hypothetical protein  33.7 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000327656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  31.67 
 
 		 855 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  35.87 
 
 		 815 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  34.48 
 
 		 1063 aa  47  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1574  TonB-dependent receptor plug  35.48 
 
 		 1155 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.923861  normal  0.0467053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  32.46 
 
 		 1010 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0176  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 924 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  26.72 
 
 		 988 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>