More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4954 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1182 aa  2419    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  62.72 
 
 		 1192 aa  1509    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 810 aa  304  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 823 aa  298  6e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4944  hypothetical protein  39.89 
 
 		 381 aa  252  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  25.53 
 
 		 822 aa  234  5e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  26.74 
 
 		 798 aa  218  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  28.99 
 
 		 897 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  26.06 
 
 		 815 aa  204  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  24.43 
 
 		 801 aa  194  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  25 
 
 		 817 aa  190  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  24.85 
 
 		 908 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  24.18 
 
 		 918 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3796  hypothetical protein  30.45 
 
 		 409 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  31.83 
 
 		 1411 aa  108  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  23.82 
 
 		 787 aa  94.7  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  24.69 
 
 		 756 aa  88.2  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  36.11 
 
 		 1163 aa  85.5  0.000000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1006 aa  84  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1004 aa  80.5  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1028 aa  79.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 		 1017 aa  78.6  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  25.08 
 
 		 1132 aa  78.6  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 		 1154 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  22.68 
 
 		 1101 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1059 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1763  TonB-dependent receptor plug  32.12 
 
 		 170 aa  77  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  40.8 
 
 		 1066 aa  76.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  38.71 
 
 		 1124 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4801  TonB-dependent receptor plug  32.04 
 
 		 1074 aa  77.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 1161 aa  77.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  34.78 
 
 		 1051 aa  77.4  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  39.66 
 
 		 1094 aa  75.5  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 1019 aa  75.9  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4011  TonB-dependent receptor plug  41.9 
 
 		 1119 aa  75.1  0.000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  25.34 
 
 		 1008 aa  74.7  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  34.59 
 
 		 1040 aa  74.7  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  37.6 
 
 		 1080 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05680  putative surface membrane protein  34.64 
 
 		 925 aa  74.3  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.718602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  26.16 
 
 		 1089 aa  74.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 1140 aa  74.3  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  38.79 
 
 		 857 aa  74.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5562  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 1080 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0203827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0057  TonB-dependent receptor plug  36.59 
 
 		 1014 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  25.86 
 
 		 1219 aa  73.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  39.39 
 
 		 1058 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  37.04 
 
 		 984 aa  73.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  38.21 
 
 		 1097 aa  73.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0321  TonB-dependent receptor plug  32.72 
 
 		 1198 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.325206 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.12 
 
 		 1029 aa  73.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.88 
 
 		 1128 aa  73.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  25.27 
 
 		 1099 aa  72.4  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 		 1152 aa  72  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  40.54 
 
 		 1093 aa  72  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 1066 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  41.58 
 
 		 1038 aa  71.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  30.38 
 
 		 1049 aa  71.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0050  TonB-dependent receptor plug  38.75 
 
 		 902 aa  71.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0269  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 		 1018 aa  70.9  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  35.04 
 
 		 1009 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  38.1 
 
 		 1013 aa  71.2  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2097  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 1110 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  36.57 
 
 		 1041 aa  70.1  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  35.47 
 
 		 1060 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 1079 aa  69.7  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  39.58 
 
 		 1034 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1021 aa  69.7  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  36.61 
 
 		 1037 aa  69.7  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 986 aa  69.7  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  40.43 
 
 		 1034 aa  69.3  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1177 aa  69.3  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1155 aa  69.3  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  35.77 
 
 		 1147 aa  68.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 1063 aa  68.9  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 986 aa  68.9  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4609  TonB-dependent receptor plug  23.71 
 
 		 1089 aa  68.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0115858  normal  0.547396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1096 aa  68.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  28.93 
 
 		 833 aa  68.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0227  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1047 aa  68.2  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.809994  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 1050 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1077 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 1011 aa  68.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2345  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 1050 aa  68.2  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.117274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  39.25 
 
 		 994 aa  68.2  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1027 aa  68.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  40.37 
 
 		 1089 aa  68.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  34.71 
 
 		 753 aa  67.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0456  TonB-dependent receptor plug  36.89 
 
 		 997 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  25.18 
 
 		 1038 aa  67.4  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3989  TonB-dependent receptor plug  26.62 
 
 		 1109 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3808  TonB-dependent receptor plug  32.61 
 
 		 1127 aa  68.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0159841  normal  0.577345 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  33.86 
 
 		 1166 aa  67.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  40.86 
 
 		 996 aa  67.8  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  39.78 
 
 		 989 aa  67  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  22.34 
 
 		 1033 aa  67  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  37.25 
 
 		 1177 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  35.19 
 
 		 1071 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.03 
 
 		 1019 aa  67  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  21.62 
 
 		 823 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1077 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>