110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3167 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  100 
 
 
1411 aa  2838    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0226  hypothetical protein  25.78 
 
 
897 aa  190  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3771  TonB-dependent receptor plug  34.12 
 
 
810 aa  160  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3208  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 
823 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00709825  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0469  hypothetical protein  25.64 
 
 
908 aa  154  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.514201  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2372  hypothetical protein  25.81 
 
 
918 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0691325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  23.24 
 
 
1403 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3041  hypothetical protein  24.39 
 
 
822 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.229998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4550  TonB-dependent receptor plug  29.51 
 
 
1192 aa  122  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.816272 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5019  hypothetical protein  30.48 
 
 
815 aa  122  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.351905  normal  0.0490542 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5846  hypothetical protein  27.08 
 
 
817 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0554  hypothetical protein  24.57 
 
 
823 aa  119  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.195396  normal  0.0453352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  26.37 
 
 
1559 aa  111  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4404  hypothetical protein  28.52 
 
 
798 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1225  hypothetical protein  27.18 
 
 
801 aa  111  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.623353  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  31.83 
 
 
1182 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2457  hypothetical protein  22.85 
 
 
756 aa  104  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.63 
 
 
1737 aa  100  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.76 
 
 
1821 aa  84.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.7 
 
 
2195 aa  80.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.44 
 
 
2191 aa  79.3  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.77 
 
 
1872 aa  78.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.36 
 
 
1953 aa  73.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.97 
 
 
1534 aa  73.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.97 
 
 
1534 aa  73.2  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.49 
 
 
1704 aa  72.4  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.84 
 
 
1785 aa  72  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  24.82 
 
 
1807 aa  70.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0719  hypothetical protein  30.07 
 
 
787 aa  70.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.49 
 
 
1650 aa  68.6  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.25 
 
 
1352 aa  68.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.57 
 
 
2002 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  22.96 
 
 
1516 aa  65.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  22.76 
 
 
1516 aa  63.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.3 
 
 
1906 aa  62.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.57 
 
 
2002 aa  62.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.22 
 
 
1307 aa  62  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  24.04 
 
 
1582 aa  61.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  22.4 
 
 
1644 aa  61.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.96 
 
 
1971 aa  61.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.54 
 
 
1971 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.42 
 
 
1646 aa  60.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.92 
 
 
1916 aa  59.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.42 
 
 
1644 aa  59.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  29.54 
 
 
1974 aa  59.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  25.84 
 
 
1603 aa  58.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.04 
 
 
1594 aa  58.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  25.65 
 
 
1534 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  22.8 
 
 
1521 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  25.65 
 
 
1504 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.26 
 
 
1644 aa  58.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  25.65 
 
 
1478 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  25.65 
 
 
1534 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  26.85 
 
 
1504 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  26.85 
 
 
1504 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.65 
 
 
1504 aa  57.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  28.1 
 
 
2067 aa  56.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.56 
 
 
1619 aa  56.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  28.1 
 
 
2055 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  28.1 
 
 
2053 aa  56.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  28.1 
 
 
2057 aa  56.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  28.1 
 
 
2055 aa  56.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  28.1 
 
 
2050 aa  56.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.07 
 
 
1596 aa  55.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.84 
 
 
1921 aa  55.5  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.36 
 
 
1594 aa  55.1  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.97 
 
 
1910 aa  54.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.13 
 
 
1652 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.1  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.13 
 
 
1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  32.76 
 
 
2064 aa  52.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.98 
 
 
2020 aa  51.6  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.57 
 
 
1859 aa  50.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.73 
 
 
1864 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.11 
 
 
1824 aa  50.4  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  25 
 
 
1739 aa  50.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.18 
 
 
2013 aa  50.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  32.53 
 
 
2012 aa  50.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  32.26 
 
 
2019 aa  49.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  22.37 
 
 
2028 aa  49.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  24.31 
 
 
1637 aa  49.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  29.13 
 
 
1925 aa  49.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.26 
 
 
2013 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.26 
 
 
2013 aa  49.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.96 
 
 
2125 aa  49.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.66 
 
 
1697 aa  48.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  30.85 
 
 
1993 aa  48.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  32.26 
 
 
2036 aa  48.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  32.65 
 
 
1869 aa  48.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.26 
 
 
2036 aa  48.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.26 
 
 
2022 aa  48.5  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.56 
 
 
1999 aa  48.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.81 
 
 
2057 aa  47.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.52 
 
 
1823 aa  47.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>