188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2870 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.56 
 
 
2002 aa  1031    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2191 aa  4330    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.12 
 
 
2002 aa  1001    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  77.72 
 
 
2195 aa  3380    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.34 
 
 
1916 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.63 
 
 
1971 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  30.1 
 
 
1974 aa  572  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.1 
 
 
1971 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.44 
 
 
1872 aa  514  1e-144  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.39 
 
 
1821 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  27.36 
 
 
1559 aa  464  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.66 
 
 
1704 aa  404  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  23.08 
 
 
1869 aa  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.92 
 
 
1737 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.47 
 
 
1906 aa  346  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.56 
 
 
1927 aa  324  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.29 
 
 
1953 aa  316  3.9999999999999997e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.09 
 
 
1823 aa  309  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.22 
 
 
1819 aa  264  1e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  22.16 
 
 
1807 aa  258  6e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.69 
 
 
1910 aa  246  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.12 
 
 
1785 aa  236  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  24.26 
 
 
1921 aa  233  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.76 
 
 
2007 aa  225  9e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.19 
 
 
2006 aa  224  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.31 
 
 
1994 aa  222  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  26.47 
 
 
1925 aa  222  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.39 
 
 
1748 aa  221  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.54 
 
 
1859 aa  218  8e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  25.27 
 
 
2016 aa  216  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.83 
 
 
2022 aa  215  7.999999999999999e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.82 
 
 
1935 aa  215  9e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.6 
 
 
2013 aa  214  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  28.03 
 
 
2064 aa  214  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  28.19 
 
 
2050 aa  214  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  28.14 
 
 
2057 aa  214  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  28.08 
 
 
2053 aa  213  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.8 
 
 
2020 aa  212  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  28.19 
 
 
2067 aa  213  5e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.35 
 
 
2013 aa  212  5e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.41 
 
 
2013 aa  212  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  28.19 
 
 
2055 aa  213  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  28.08 
 
 
2055 aa  211  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  26.73 
 
 
2036 aa  206  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.73 
 
 
2036 aa  206  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.54 
 
 
2057 aa  206  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.73 
 
 
2022 aa  205  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  26.38 
 
 
2019 aa  203  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.67 
 
 
2012 aa  202  7.999999999999999e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.93 
 
 
1757 aa  199  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.79 
 
 
1352 aa  199  6e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.86 
 
 
1534 aa  197  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.68 
 
 
1534 aa  195  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.94 
 
 
2125 aa  194  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  25.86 
 
 
1993 aa  192  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.39 
 
 
1999 aa  190  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  24.09 
 
 
1839 aa  188  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  26.72 
 
 
1603 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  25.02 
 
 
1759 aa  183  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.3 
 
 
1768 aa  181  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  25.4 
 
 
1516 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.06 
 
 
1872 aa  177  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  26.22 
 
 
1582 aa  176  3.9999999999999995e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.18 
 
 
1872 aa  175  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.97 
 
 
1594 aa  175  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  25.12 
 
 
1516 aa  174  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.9 
 
 
1596 aa  173  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  25.66 
 
 
1521 aa  173  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.03 
 
 
1594 aa  171  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.66 
 
 
1872 aa  163  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  22.4 
 
 
1898 aa  162  6e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.62 
 
 
1653 aa  160  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.12 
 
 
1635 aa  160  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.57 
 
 
1772 aa  159  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.62 
 
 
1653 aa  158  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.62 
 
 
1653 aa  158  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1653 aa  158  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1653 aa  158  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.88 
 
 
1765 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.35 
 
 
1653 aa  156  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.57 
 
 
1653 aa  156  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.53 
 
 
1652 aa  154  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  21.37 
 
 
1921 aa  152  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.1 
 
 
1758 aa  152  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.39 
 
 
1653 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.6 
 
 
1641 aa  149  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  23.66 
 
 
1641 aa  149  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.14 
 
 
1633 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  23.66 
 
 
1727 aa  147  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.5 
 
 
1835 aa  145  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21 
 
 
1307 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  23.21 
 
 
1644 aa  144  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.42 
 
 
1992 aa  142  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.42 
 
 
1992 aa  141  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  22.39 
 
 
1637 aa  142  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.65 
 
 
1895 aa  141  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.41 
 
 
1998 aa  140  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.97 
 
 
1646 aa  140  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.87 
 
 
1628 aa  140  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.03 
 
 
1682 aa  139  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>