144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0241 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 
1935 aa  3863    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.11 
 
 
2002 aa  225  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.5 
 
 
1971 aa  219  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.49 
 
 
1971 aa  219  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  25.38 
 
 
1974 aa  217  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.97 
 
 
2191 aa  215  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.82 
 
 
1821 aa  214  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.63 
 
 
1916 aa  209  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.72 
 
 
2002 aa  206  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.16 
 
 
2195 aa  202  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.25 
 
 
1872 aa  193  2.9999999999999997e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.24 
 
 
1704 aa  174  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.34 
 
 
1927 aa  171  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
2020 aa  162  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.38 
 
 
1768 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.58 
 
 
1737 aa  153  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.48 
 
 
1906 aa  149  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  23.62 
 
 
1921 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.54 
 
 
1772 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  23.11 
 
 
1559 aa  139  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.47 
 
 
2013 aa  138  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.26 
 
 
1785 aa  135  6.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.06 
 
 
1953 aa  135  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  23.66 
 
 
2064 aa  133  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  23.54 
 
 
2053 aa  133  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  23.46 
 
 
2050 aa  134  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  24.03 
 
 
2055 aa  132  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  24.03 
 
 
2055 aa  132  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  23.54 
 
 
2067 aa  132  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.28 
 
 
1765 aa  132  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  24 
 
 
2057 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.15 
 
 
1758 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  23.76 
 
 
2019 aa  129  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.27 
 
 
2013 aa  129  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.65 
 
 
2012 aa  129  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.46 
 
 
1994 aa  127  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.27 
 
 
2013 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.08 
 
 
2006 aa  127  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.7 
 
 
1807 aa  126  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.84 
 
 
2016 aa  125  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.19 
 
 
1925 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
2022 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.58 
 
 
1823 aa  121  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  23.66 
 
 
2036 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 
2036 aa  122  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.64 
 
 
1759 aa  115  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.26 
 
 
2000 aa  115  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  25.65 
 
 
1815 aa  115  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  23 
 
 
2002 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  22.97 
 
 
2000 aa  114  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.97 
 
 
2000 aa  114  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.55 
 
 
1910 aa  113  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.13 
 
 
1768 aa  112  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  22.77 
 
 
1898 aa  110  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.33 
 
 
2007 aa  109  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.99 
 
 
1872 aa  110  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.32 
 
 
1737 aa  109  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.99 
 
 
2022 aa  107  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.08 
 
 
1872 aa  107  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.17 
 
 
1872 aa  105  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.92 
 
 
1864 aa  105  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.26 
 
 
1808 aa  103  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.74 
 
 
1697 aa  103  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  25.26 
 
 
1808 aa  103  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  21.6 
 
 
1834 aa  103  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.57 
 
 
1682 aa  102  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  23.81 
 
 
1737 aa  100  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 
1663 aa  99.8  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.89 
 
 
1737 aa  99.4  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.39 
 
 
1805 aa  97.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.12 
 
 
1737 aa  96.3  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.12 
 
 
1869 aa  95.5  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.62 
 
 
1664 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.42 
 
 
1832 aa  92.4  9e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.12 
 
 
1824 aa  91.3  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  22.73 
 
 
1743 aa  90.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  24.55 
 
 
1727 aa  89.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.89 
 
 
1819 aa  89.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.97 
 
 
1993 aa  89.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.71 
 
 
1854 aa  88.2  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  26.98 
 
 
1803 aa  86.7  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  23.08 
 
 
1738 aa  85.9  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.37 
 
 
1992 aa  85.5  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.37 
 
 
1992 aa  85.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  23.79 
 
 
1665 aa  84.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.4 
 
 
1632 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.26 
 
 
1633 aa  84  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.27 
 
 
1998 aa  84  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.71 
 
 
1782 aa  83.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.26 
 
 
1633 aa  83.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.69 
 
 
2058 aa  83.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.92 
 
 
1619 aa  82.8  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.86 
 
 
2025 aa  82.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.47 
 
 
1633 aa  82  0.00000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.26 
 
 
1808 aa  81.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.41 
 
 
1352 aa  79.7  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.08 
 
 
1534 aa  79.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  20.82 
 
 
1761 aa  79  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.29 
 
 
1534 aa  77.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.92 
 
 
1835 aa  77.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>