195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2190 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2002 aa  3965    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.51 
 
 
2191 aa  1033    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  86.58 
 
 
2002 aa  3414    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.45 
 
 
2195 aa  1009    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  26 
 
 
1916 aa  558  1e-157  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.91 
 
 
1971 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.9 
 
 
1971 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.95 
 
 
1821 aa  476  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.05 
 
 
1872 aa  476  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  26.71 
 
 
1559 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  28.18 
 
 
1974 aa  465  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.99 
 
 
1704 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.98 
 
 
1737 aa  349  3e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.13 
 
 
1906 aa  338  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.06 
 
 
2057 aa  331  8e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.06 
 
 
1869 aa  323  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.42 
 
 
1927 aa  301  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.57 
 
 
1823 aa  300  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.02 
 
 
1953 aa  293  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.18 
 
 
2125 aa  265  8.999999999999999e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.13 
 
 
1785 aa  238  7e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.32 
 
 
1748 aa  234  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  22.02 
 
 
1807 aa  233  4e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.54 
 
 
2013 aa  227  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.89 
 
 
1910 aa  226  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.44 
 
 
1757 aa  219  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.99 
 
 
1935 aa  210  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.24 
 
 
1534 aa  209  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.33 
 
 
1819 aa  209  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.24 
 
 
1534 aa  208  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.73 
 
 
1352 aa  204  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  22.72 
 
 
1921 aa  199  5.000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.91 
 
 
2013 aa  197  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  23.67 
 
 
2019 aa  194  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.85 
 
 
1859 aa  184  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.89 
 
 
2013 aa  184  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.46 
 
 
2022 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  24.55 
 
 
2036 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.55 
 
 
2036 aa  180  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  22.92 
 
 
1993 aa  179  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  24.09 
 
 
2050 aa  173  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  24.17 
 
 
2064 aa  172  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.46 
 
 
2020 aa  171  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  24.14 
 
 
2067 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.02 
 
 
1663 aa  171  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  24.02 
 
 
2053 aa  171  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.18 
 
 
1708 aa  171  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  24.07 
 
 
2055 aa  171  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.96 
 
 
1823 aa  170  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  24.07 
 
 
2055 aa  169  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  24.1 
 
 
2057 aa  169  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.76 
 
 
1925 aa  168  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.14 
 
 
2019 aa  168  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.63 
 
 
1652 aa  166  6e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.7 
 
 
1653 aa  165  8.000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  22.7 
 
 
1653 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  22.7 
 
 
1653 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.11 
 
 
1594 aa  164  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.7 
 
 
1653 aa  164  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.7 
 
 
1653 aa  164  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.36 
 
 
2006 aa  163  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.67 
 
 
1994 aa  163  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.63 
 
 
1653 aa  162  6e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  22.08 
 
 
1644 aa  162  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.67 
 
 
1641 aa  161  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.61 
 
 
1594 aa  160  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.62 
 
 
1653 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.86 
 
 
1644 aa  159  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.57 
 
 
1619 aa  158  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.01 
 
 
1835 aa  158  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  21.75 
 
 
1665 aa  157  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  24.05 
 
 
1521 aa  157  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.48 
 
 
2007 aa  157  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.63 
 
 
1653 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  23.52 
 
 
1641 aa  156  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.51 
 
 
1650 aa  156  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  21.93 
 
 
1646 aa  155  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  21.97 
 
 
1644 aa  156  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.19 
 
 
2022 aa  155  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  24.09 
 
 
2016 aa  154  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  24.78 
 
 
2002 aa  154  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  22.64 
 
 
1925 aa  152  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  23.67 
 
 
1737 aa  151  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.41 
 
 
1832 aa  151  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  24.54 
 
 
1478 aa  150  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  24.45 
 
 
1582 aa  148  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  23.36 
 
 
2028 aa  146  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.11 
 
 
2000 aa  146  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.08 
 
 
1737 aa  146  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.16 
 
 
1652 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  24.33 
 
 
2000 aa  145  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.06 
 
 
1621 aa  145  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.33 
 
 
2000 aa  145  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.6 
 
 
1743 aa  144  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.73 
 
 
1872 aa  143  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  23.9 
 
 
1808 aa  142  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.76 
 
 
1737 aa  141  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.33 
 
 
1872 aa  141  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  23.53 
 
 
1744 aa  140  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  23.4 
 
 
1603 aa  141  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>