97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2494 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  42.67 
 
 
2173 aa  638    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  37.88 
 
 
2058 aa  1258    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  37.68 
 
 
2025 aa  1266    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  33.75 
 
 
1994 aa  1056    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  32.35 
 
 
2084 aa  1015    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  100 
 
 
2028 aa  4220    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  25.54 
 
 
1908 aa  476  1e-132  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.42 
 
 
2019 aa  348  6e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.5 
 
 
2002 aa  143  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.79 
 
 
2002 aa  132  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.86 
 
 
2125 aa  127  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.1 
 
 
2191 aa  121  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  20.51 
 
 
1559 aa  117  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.38 
 
 
1737 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.54 
 
 
2195 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.14 
 
 
1704 aa  107  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.94 
 
 
2057 aa  98.2  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.82 
 
 
1916 aa  94  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.53 
 
 
1971 aa  79.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.6 
 
 
1352 aa  73.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.72 
 
 
1534 aa  72  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.42 
 
 
1534 aa  71.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  21.85 
 
 
1974 aa  70.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.43 
 
 
1971 aa  67.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.31 
 
 
1927 aa  66.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  25 
 
 
1935 aa  65.5  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  24.9 
 
 
1807 aa  64.7  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  23.78 
 
 
1516 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  23.45 
 
 
1516 aa  63.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.93 
 
 
1819 aa  61.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.36 
 
 
1821 aa  60.8  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.95 
 
 
1594 aa  60.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  25.33 
 
 
1874 aa  60.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  26.2 
 
 
1521 aa  59.7  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  30.68 
 
 
1906 aa  59.3  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.15 
 
 
1594 aa  58.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.54 
 
 
2012 aa  57.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.51 
 
 
1953 aa  57.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.31 
 
 
2007 aa  55.5  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  29.59 
 
 
1869 aa  55.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.56 
 
 
1307 aa  55.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.33 
 
 
1910 aa  55.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.97 
 
 
2022 aa  54.3  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  28.36 
 
 
2016 aa  54.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  24.21 
 
 
1834 aa  53.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.97 
 
 
2036 aa  53.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  31.97 
 
 
2036 aa  53.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.97 
 
 
2022 aa  53.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  31.97 
 
 
2019 aa  53.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.79 
 
 
1823 aa  53.1  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.97 
 
 
1994 aa  53.5  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.19 
 
 
1999 aa  53.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.64 
 
 
1835 aa  52.8  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.35 
 
 
2006 aa  52  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.43 
 
 
1823 aa  52  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  23.13 
 
 
1665 aa  52.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.05 
 
 
1872 aa  52  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  30.33 
 
 
2067 aa  52.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  30.33 
 
 
2055 aa  52  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  30.33 
 
 
2055 aa  52.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  30.33 
 
 
2053 aa  52.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  30.33 
 
 
2057 aa  52  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  30.33 
 
 
2050 aa  52  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  30.17 
 
 
1534 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  30.17 
 
 
1534 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  30.17 
 
 
1478 aa  51.6  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.6 
 
 
1925 aa  51.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.26 
 
 
1582 aa  51.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  30.17 
 
 
1504 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  30.17 
 
 
1504 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.51 
 
 
2013 aa  51.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.17 
 
 
1504 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  30.17 
 
 
1504 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  29.27 
 
 
1993 aa  50.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.1 
 
 
1737 aa  50.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  22.37 
 
 
1411 aa  50.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  29.25 
 
 
1921 aa  49.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  29.51 
 
 
2064 aa  49.3  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  31.31 
 
 
1603 aa  49.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.33 
 
 
2013 aa  49.3  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  22.05 
 
 
1727 aa  49.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30.33 
 
 
2013 aa  49.3  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  31.31 
 
 
1596 aa  49.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.81 
 
 
1864 aa  48.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.79 
 
 
1697 aa  48.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.95 
 
 
1859 aa  48.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  23.02 
 
 
1637 aa  48.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  30 
 
 
2020 aa  47.4  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.59 
 
 
1628 aa  47.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  24.49 
 
 
1803 aa  47  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  24.91 
 
 
1737 aa  47  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.28 
 
 
1635 aa  46.6  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.82 
 
 
1641 aa  46.6  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  24.82 
 
 
1641 aa  46.2  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.89 
 
 
1663 aa  45.8  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 
1979 aa  45.8  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.39 
 
 
1737 aa  45.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>