72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3939 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 1757 aa  3415    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  62.09 
 
 		 1748 aa  2050    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.82 
 
 		 1708 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.55 
 
 		 2002 aa  225  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.26 
 
 		 2002 aa  224  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.93 
 
 		 2191 aa  214  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.38 
 
 		 2195 aa  189  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0161  hypothetical protein  25.41 
 
 		 1591 aa  144  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330881  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.35 
 
 		 1821 aa  97.8  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.21 
 
 		 1823 aa  92.8  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.66 
 
 		 1971 aa  86.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.54 
 
 		 1971 aa  82  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  24.38 
 
 		 1559 aa  80.1  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  28.75 
 
 		 595 aa  78.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.14 
 
 		 1872 aa  71.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.65 
 
 		 1737 aa  70.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.12 
 
 		 1686 aa  68.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  22.57 
 
 		 1974 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  25.87 
 
 		 352 aa  68.2  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  19.82 
 
 		 1906 aa  67.4  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.08 
 
 		 1704 aa  67  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.19 
 
 		 4761 aa  65.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.57 
 
 		 2019 aa  63.9  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.44 
 
 		 1594 aa  62  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.43 
 
 		 1916 aa  61.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  25.36 
 
 		 1590 aa  59.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  28.26 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.48 
 
 		 1785 aa  57.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.81 
 
 		 1619 aa  57  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.32 
 
 		 1650 aa  54.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.9  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.4 
 
 		 1594 aa  53.5  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.43 
 
 		 1652 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.43 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.82 
 
 		 1992 aa  53.5  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.82 
 
 		 1992 aa  53.5  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  23.36 
 
 		 1652 aa  53.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 		 1998 aa  52.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  27.61 
 
 		 1646 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  27.61 
 
 		 1644 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1644 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1644 aa  51.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.57 
 
 		 693 aa  50.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.3 
 
 		 1927 aa  51.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1807 aa  51.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1516 aa  51.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.04 
 
 		 1352 aa  51.2  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  27.54 
 
 		 1925 aa  50.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.78 
 
 		 1627 aa  50.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  24.93 
 
 		 1516 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.64 
 
 		 1935 aa  50.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  22.63 
 
 		 1649 aa  50.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  22.81 
 
 		 4697 aa  48.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.32 
 
 		 1782 aa  47.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.81 
 
 		 1869 aa  47.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1838 aa  47  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1603 aa  47.4  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.19 
 
 		 2057 aa  47.4  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  26.01 
 
 		 656 aa  46.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.21 
 
 		 1697 aa  46.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.16 
 
 		 1682 aa  47  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3641  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.76 
 
 		 406 aa  46.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0709667  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3714  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.76 
 
 		 406 aa  46.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.758316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3646  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.76 
 
 		 406 aa  46.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.759222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.97 
 
 		 1664 aa  45.8  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  35.29 
 
 		 1627 aa  45.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>