130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5103 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  53.25 
 
 		 1534 aa  1612    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  48.14 
 
 		 1582 aa  1393    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  71.5 
 
 		 1521 aa  2185    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  53.25 
 
 		 1534 aa  1612    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  47.1 
 
 		 1603 aa  1355    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  54.04 
 
 		 1478 aa  1588    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  98.02 
 
 		 1516 aa  2996    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  100 
 
 		 1516 aa  3038    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  53.89 
 
 		 1504 aa  1615    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  53.76 
 
 		 1504 aa  1611    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  48.3 
 
 		 1594 aa  1400    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.76 
 
 		 1504 aa  1611    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  53.63 
 
 		 1504 aa  1611    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  47.68 
 
 		 1596 aa  1370    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  47.8 
 
 		 1594 aa  1397    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  23.98 
 
 		 1559 aa  221  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.52 
 
 		 2195 aa  191  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.03 
 
 		 2191 aa  186  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.05 
 
 		 1737 aa  185  7e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.13 
 
 		 1704 aa  177  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.18 
 
 		 1872 aa  176  3.9999999999999995e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.92 
 
 		 1821 aa  169  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.81 
 
 		 1534 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.58 
 
 		 1534 aa  149  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.96 
 
 		 2002 aa  147  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.07 
 
 		 2002 aa  138  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.93 
 
 		 1352 aa  124  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.55 
 
 		 1785 aa  108  6e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.96 
 
 		 1628 aa  104  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.02 
 
 		 1307 aa  104  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.19 
 
 		 1971 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.36 
 
 		 1869 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.3 
 
 		 1921 aa  98.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1807 aa  96.7  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1921 aa  95.1  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  27.04 
 
 		 1974 aa  95.1  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.61 
 
 		 1971 aa  94.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.18 
 
 		 1953 aa  93.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.81 
 
 		 1906 aa  91.7  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.68 
 
 		 1994 aa  87  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.68 
 
 		 1916 aa  86.3  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.14 
 
 		 1635 aa  83.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.95 
 
 		 1921 aa  79.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.89 
 
 		 1859 aa  77.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.84 
 
 		 1925 aa  77  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.12 
 
 		 2057 aa  76.6  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.4 
 
 		 1927 aa  75.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  23.92 
 
 		 2002 aa  73.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.82 
 
 		 1998 aa  73.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.26 
 
 		 1833 aa  72.4  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1641 aa  72.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.82 
 
 		 1992 aa  72.4  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.69 
 
 		 1992 aa  72  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.49 
 
 		 2084 aa  70.5  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.93 
 
 		 1935 aa  69.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.07 
 
 		 1819 aa  69.3  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  23.78 
 
 		 2000 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.78 
 
 		 2000 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  23.51 
 
 		 1637 aa  67.8  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  23.45 
 
 		 2028 aa  65.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  22.96 
 
 		 1411 aa  65.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.26 
 
 		 1823 aa  65.1  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  21.35 
 
 		 1665 aa  63.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.46 
 
 		 2025 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.63 
 
 		 2022 aa  63.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.52 
 
 		 2000 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.98 
 
 		 1641 aa  63.2  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.33 
 
 		 2125 aa  62.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  23.74 
 
 		 1403 aa  61.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.68 
 
 		 2173 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  25.83 
 
 		 2019 aa  58.2  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  26.24 
 
 		 2036 aa  58.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.43 
 
 		 2013 aa  57.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.24 
 
 		 2036 aa  58.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  26.59 
 
 		 2050 aa  57.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.43 
 
 		 2013 aa  58.2  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.51 
 
 		 1898 aa  57.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  26.51 
 
 		 2064 aa  57.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.35 
 
 		 2022 aa  57.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.78 
 
 		 2020 aa  57.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.92 
 
 		 2013 aa  56.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  26.39 
 
 		 2055 aa  56.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  25 
 
 		 2057 aa  55.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  41.43 
 
 		 1874 aa  56.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  25 
 
 		 2055 aa  55.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.12 
 
 		 2058 aa  55.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  26.19 
 
 		 2053 aa  55.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.93 
 
 		 1619 aa  55.5  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.88 
 
 		 1759 aa  54.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  22.42 
 
 		 1925 aa  54.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.44 
 
 		 1999 aa  55.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.92 
 
 		 1653 aa  54.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  23.96 
 
 		 2067 aa  54.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.92 
 
 		 1653 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.92 
 
 		 1653 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.92 
 
 		 1653 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.63 
 
 		 1653 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1653 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  23.84 
 
 		 2016 aa  53.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>