153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1752 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  100 
 
 
1921 aa  3878    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  43.33 
 
 
2006 aa  1450    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  41.78 
 
 
2055 aa  1202    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  42.51 
 
 
2016 aa  1451    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  41.72 
 
 
2067 aa  1200    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  41.42 
 
 
2019 aa  1416    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  42.11 
 
 
2064 aa  1207    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  42.15 
 
 
1993 aa  1445    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  42.01 
 
 
1925 aa  1349    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  42.11 
 
 
2036 aa  1436    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  41.92 
 
 
2013 aa  1430    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.24 
 
 
2013 aa  1436    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.11 
 
 
2020 aa  1485    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.11 
 
 
2036 aa  1436    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  43.98 
 
 
2007 aa  1481    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.87 
 
 
1999 aa  1451    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  43.43 
 
 
2022 aa  1456    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  41.78 
 
 
2055 aa  1204    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  41.57 
 
 
2053 aa  1199    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  41.75 
 
 
2050 aa  1202    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  41.77 
 
 
2057 aa  1204    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  42.57 
 
 
2012 aa  1502    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.82 
 
 
1910 aa  1390    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.11 
 
 
2022 aa  1436    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42.33 
 
 
1994 aa  1433    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  42 
 
 
2013 aa  1420    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.47 
 
 
1872 aa  340  9.999999999999999e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.47 
 
 
1974 aa  304  1e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.18 
 
 
1916 aa  303  2e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.58 
 
 
1971 aa  290  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.71 
 
 
1971 aa  290  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.45 
 
 
1821 aa  272  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.37 
 
 
1953 aa  254  9.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.12 
 
 
2191 aa  232  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.86 
 
 
2195 aa  203  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 
1737 aa  199  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.59 
 
 
2002 aa  195  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.64 
 
 
2002 aa  189  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.74 
 
 
1906 aa  187  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  20.75 
 
 
1559 aa  156  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.64 
 
 
1927 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.64 
 
 
1823 aa  144  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.28 
 
 
1704 aa  144  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.66 
 
 
1785 aa  132  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.86 
 
 
1935 aa  132  9.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.13 
 
 
1869 aa  129  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.63 
 
 
1758 aa  125  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.42 
 
 
1768 aa  126  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.34 
 
 
1765 aa  125  8e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.52 
 
 
1807 aa  123  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.19 
 
 
1768 aa  123  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.89 
 
 
1819 aa  119  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.2 
 
 
1772 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.09 
 
 
1772 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.73 
 
 
1835 aa  115  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.88 
 
 
1737 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  22.9 
 
 
1739 aa  107  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.75 
 
 
1823 aa  106  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  22.41 
 
 
1737 aa  102  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.88 
 
 
1992 aa  101  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.92 
 
 
1998 aa  100  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.94 
 
 
1992 aa  100  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  22.67 
 
 
1649 aa  96.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.49 
 
 
1759 aa  96.3  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  22.47 
 
 
1738 aa  95.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.3 
 
 
1737 aa  95.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  22.89 
 
 
1504 aa  93.6  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.36 
 
 
1652 aa  93.2  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  22.28 
 
 
1534 aa  91.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  22.28 
 
 
1534 aa  91.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  22.89 
 
 
1504 aa  91.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.28 
 
 
1504 aa  91.3  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.43 
 
 
1652 aa  90.5  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.36 
 
 
1859 aa  89.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.76 
 
 
1478 aa  88.6  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.08 
 
 
1653 aa  88.6  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.13 
 
 
1644 aa  87.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.08 
 
 
1743 aa  88.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  22.76 
 
 
1504 aa  87.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 
1632 aa  87.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  21.35 
 
 
1641 aa  87  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.1 
 
 
1646 aa  86.7  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.17 
 
 
1650 aa  85.9  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.02 
 
 
1653 aa  85.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.18 
 
 
1641 aa  85.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.37 
 
 
1644 aa  85.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 
1633 aa  85.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.87 
 
 
1653 aa  85.1  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.99 
 
 
1664 aa  84.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.91 
 
 
1697 aa  84.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  21.83 
 
 
1653 aa  83.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.43 
 
 
1633 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  21.83 
 
 
1653 aa  83.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.15 
 
 
1653 aa  83.2  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.15 
 
 
1653 aa  83.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  21.99 
 
 
1644 aa  82.8  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.96 
 
 
1653 aa  82.8  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  19.68 
 
 
1921 aa  82.8  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 
1832 aa  82.4  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.29 
 
 
1737 aa  82  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>