147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2963 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  43.46 
 
 
1534 aa  1269    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  88.83 
 
 
1582 aa  2835    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  43.46 
 
 
1534 aa  1269    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  48.97 
 
 
1521 aa  1400    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  64.72 
 
 
1603 aa  2007    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  48.37 
 
 
1516 aa  1370    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  43.98 
 
 
1478 aa  1249    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  97.87 
 
 
1594 aa  3126    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  48.46 
 
 
1516 aa  1375    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  44.08 
 
 
1504 aa  1268    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  44.01 
 
 
1504 aa  1266    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 
1594 aa  3215    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  44.14 
 
 
1504 aa  1269    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  44.24 
 
 
1504 aa  1268    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  63.69 
 
 
1596 aa  1983    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.39 
 
 
1737 aa  240  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  24.65 
 
 
1559 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.13 
 
 
1704 aa  204  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.84 
 
 
2191 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.63 
 
 
2002 aa  164  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.78 
 
 
2195 aa  159  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.49 
 
 
2002 aa  154  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.93 
 
 
1821 aa  147  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.69 
 
 
1872 aa  111  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.81 
 
 
2125 aa  103  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  24.93 
 
 
1906 aa  99.8  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  23.5 
 
 
2002 aa  97.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.83 
 
 
1628 aa  97.4  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.95 
 
 
1927 aa  95.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.48 
 
 
2006 aa  92.8  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.54 
 
 
1307 aa  90.5  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.27 
 
 
1823 aa  89.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.63 
 
 
1994 aa  89.4  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.14 
 
 
1916 aa  89  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  20.23 
 
 
1637 aa  88.6  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.97 
 
 
2022 aa  87.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.39 
 
 
1635 aa  85.5  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  22.65 
 
 
1921 aa  84.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.79 
 
 
1352 aa  84  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.48 
 
 
2057 aa  82.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.19 
 
 
1999 aa  82.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  23.6 
 
 
2000 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.6 
 
 
2000 aa  82  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.4 
 
 
1921 aa  82  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.85 
 
 
1993 aa  80.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.25 
 
 
1534 aa  80.1  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.25 
 
 
1534 aa  80.1  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.13 
 
 
1765 aa  79.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.5 
 
 
2000 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.27 
 
 
1859 aa  77.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.92 
 
 
1641 aa  77.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.53 
 
 
1807 aa  77  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.1 
 
 
1897 aa  76.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  22.92 
 
 
1641 aa  75.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  23.2 
 
 
1737 aa  75.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.06 
 
 
1768 aa  75.5  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.62 
 
 
1619 aa  74.7  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.8 
 
 
1921 aa  74.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.31 
 
 
1768 aa  72.4  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.61 
 
 
1785 aa  72  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.51 
 
 
1819 aa  71.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.96 
 
 
1971 aa  71.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  24.44 
 
 
1737 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.09 
 
 
1743 aa  70.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  26.18 
 
 
1974 aa  70.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  23.86 
 
 
1717 aa  70.1  0.0000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  21.99 
 
 
1805 aa  69.3  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  23.24 
 
 
1727 aa  68.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  22.38 
 
 
1808 aa  68.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  25.42 
 
 
1869 aa  68.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.17 
 
 
1808 aa  68.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  24.05 
 
 
1748 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  20.82 
 
 
1925 aa  67.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.06 
 
 
1925 aa  67.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.36 
 
 
2025 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.27 
 
 
1872 aa  66.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.18 
 
 
1737 aa  66.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.94 
 
 
2173 aa  66.2  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  24.49 
 
 
1738 aa  65.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.91 
 
 
1758 aa  64.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.29 
 
 
1823 aa  64.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  21.9 
 
 
1739 aa  64.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.27 
 
 
1737 aa  64.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  22.81 
 
 
1803 aa  63.5  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.22 
 
 
2020 aa  63.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.58 
 
 
1953 aa  63.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25 
 
 
1998 aa  63.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.98 
 
 
1971 aa  63.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25 
 
 
1992 aa  63.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.12 
 
 
1872 aa  62.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.2 
 
 
1759 aa  62  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.71 
 
 
1992 aa  62.4  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.23 
 
 
1832 aa  62  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.34 
 
 
2013 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  30.35 
 
 
1994 aa  61.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.53 
 
 
1772 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  23.95 
 
 
2028 aa  60.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.53 
 
 
1772 aa  61.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.66 
 
 
2013 aa  60.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  25.6 
 
 
1979 aa  59.7  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>