96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3210 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  36.04 
 
 		 1994 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 		 2025 aa  4209    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  42.33 
 
 		 2058 aa  1536    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  37.48 
 
 		 2028 aa  1267    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  45.42 
 
 		 2084 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  41.98 
 
 		 2173 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.12 
 
 		 2019 aa  384  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  28.36 
 
 		 1908 aa  315  4.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.43 
 
 		 2125 aa  170  2.9999999999999998e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.85 
 
 		 2057 aa  137  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.81 
 
 		 1704 aa  118  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.76 
 
 		 2002 aa  117  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.15 
 
 		 2191 aa  114  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  19.52 
 
 		 1559 aa  96.7  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.7 
 
 		 1737 aa  96.3  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.65 
 
 		 1872 aa  82.8  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.86 
 
 		 1935 aa  82  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.92 
 
 		 2002 aa  80.1  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.34 
 
 		 1821 aa  77.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1807 aa  73.6  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.21 
 
 		 1916 aa  73.2  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.1 
 
 		 1971 aa  69.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.35 
 
 		 2195 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.36 
 
 		 1594 aa  67.4  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.48 
 
 		 1352 aa  67  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.67 
 
 		 1819 aa  66.6  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.69 
 
 		 1974 aa  65.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.69 
 
 		 1971 aa  64.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.52 
 
 		 1534 aa  64.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.52 
 
 		 1534 aa  64.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1603 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  24.72 
 
 		 1521 aa  64.7  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1834 aa  64.3  0.00000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  27.16 
 
 		 1925 aa  63.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1516 aa  63.2  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  22.66 
 
 		 1534 aa  62.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1534 aa  62.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.21 
 
 		 1835 aa  62.8  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.66 
 
 		 1504 aa  62.8  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  26.71 
 
 		 1582 aa  62  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1516 aa  62  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  34 
 
 		 1906 aa  62.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.03 
 
 		 1594 aa  61.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.54 
 
 		 1596 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  32.54 
 
 		 1869 aa  61.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.85 
 
 		 1823 aa  60.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  22.78 
 
 		 1504 aa  58.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  22.78 
 
 		 1504 aa  58.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.78 
 
 		 1478 aa  58.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.36 
 
 		 1927 aa  57.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.95 
 
 		 1859 aa  57.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  24.36 
 
 		 1874 aa  57.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  23.83 
 
 		 1504 aa  57.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.04 
 
 		 1872 aa  57  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.64 
 
 		 1953 aa  55.5  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.42 
 
 		 1832 aa  54.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.61 
 
 		 1872 aa  54.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.43 
 
 		 1628 aa  54.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  28 
 
 		 1403 aa  54.3  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.18 
 
 		 1872 aa  53.9  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.35 
 
 		 1635 aa  53.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  25.11 
 
 		 1805 aa  53.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  24.11 
 
 		 1665 aa  53.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1898 aa  52.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  23.26 
 
 		 1979 aa  52.8  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.98 
 
 		 1653 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.97 
 
 		 1307 aa  50.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  21.61 
 
 		 1646 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  23.6 
 
 		 1737 aa  50.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.61 
 
 		 1644 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  24.81 
 
 		 1921 aa  49.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.65 
 
 		 1653 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.83 
 
 		 1697 aa  49.7  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  24.09 
 
 		 1921 aa  49.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.65 
 
 		 1653 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.78 
 
 		 1992 aa  49.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.78 
 
 		 1998 aa  49.7  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1653 aa  49.3  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  22.65 
 
 		 1653 aa  49.3  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.78 
 
 		 1992 aa  49.3  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.65 
 
 		 1653 aa  48.9  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  21.61 
 
 		 1644 aa  48.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1644 aa  48.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.51 
 
 		 1824 aa  48.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.33 
 
 		 1650 aa  48.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.33 
 
 		 1653 aa  48.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.33 
 
 		 1653 aa  47.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.42 
 
 		 1652 aa  47.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1921 aa  47.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.23 
 
 		 1785 aa  47.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  19.63 
 
 		 1759 aa  48.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.95 
 
 		 1737 aa  47.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.32 
 
 		 1768 aa  47  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.3 
 
 		 1737 aa  47.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.41 
 
 		 1823 aa  46.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.16 
 
 		 1782 aa  45.8  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>