129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1157 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 		 2057 aa  4200    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  32.31 
 
 		 2125 aa  886    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.37 
 
 		 2002 aa  361  8e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.35 
 
 		 2002 aa  280  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.54 
 
 		 2019 aa  273  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  27.3 
 
 		 1559 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.29 
 
 		 2025 aa  259  3e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.74 
 
 		 1737 aa  247  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.39 
 
 		 2058 aa  236  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.52 
 
 		 1704 aa  231  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.04 
 
 		 2191 aa  229  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.08 
 
 		 1916 aa  226  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  22.88 
 
 		 2028 aa  225  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.44 
 
 		 2195 aa  215  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  22.69 
 
 		 1994 aa  196  4e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  26.39 
 
 		 1974 aa  169  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.57 
 
 		 1869 aa  162  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.03 
 
 		 1971 aa  161  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.05 
 
 		 2084 aa  160  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.4 
 
 		 1821 aa  158  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.31 
 
 		 1953 aa  153  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.03 
 
 		 2173 aa  153  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.06 
 
 		 1971 aa  142  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.57 
 
 		 1872 aa  134  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.28 
 
 		 1534 aa  130  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.6 
 
 		 1906 aa  127  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.57 
 
 		 1534 aa  124  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.67 
 
 		 1352 aa  111  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  22.62 
 
 		 1908 aa  108  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.31 
 
 		 1307 aa  105  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  20.48 
 
 		 1521 aa  102  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.57 
 
 		 1823 aa  98.6  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  22.35 
 
 		 1665 aa  92.8  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.01 
 
 		 1927 aa  92.4  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.84 
 
 		 1819 aa  92  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  22.05 
 
 		 1979 aa  87.8  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.59 
 
 		 1594 aa  85.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.69 
 
 		 1785 aa  83.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1603 aa  82.8  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  20.86 
 
 		 1874 aa  82.4  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  21.86 
 
 		 1403 aa  80.5  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 		 1596 aa  80.5  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.14 
 
 		 1594 aa  80.5  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.62 
 
 		 1832 aa  77.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  23.79 
 
 		 1582 aa  76.6  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21.78 
 
 		 1807 aa  76.6  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1516 aa  73.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  21.12 
 
 		 1516 aa  73.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.31 
 
 		 1935 aa  73.2  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.44 
 
 		 1628 aa  69.3  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.16 
 
 		 1921 aa  66.6  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  19.35 
 
 		 1504 aa  65.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  19.97 
 
 		 1504 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  19.97 
 
 		 1534 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.12 
 
 		 1633 aa  63.9  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.97 
 
 		 1504 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  19.97 
 
 		 1534 aa  63.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.99 
 
 		 1633 aa  63.5  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  20.14 
 
 		 1504 aa  63.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.24 
 
 		 1652 aa  63.5  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.89 
 
 		 1632 aa  63.2  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.48 
 
 		 1653 aa  62.4  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.88 
 
 		 1835 aa  62  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.71 
 
 		 1782 aa  62  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.19 
 
 		 2000 aa  62  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.85 
 
 		 1653 aa  62.4  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.56 
 
 		 1805 aa  61.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.8 
 
 		 1765 aa  61.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.75 
 
 		 1653 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.8 
 
 		 1824 aa  61.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.9 
 
 		 1758 aa  60.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  19.62 
 
 		 1478 aa  59.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.68 
 
 		 1653 aa  59.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.04 
 
 		 1823 aa  59.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.68 
 
 		 1653 aa  59.7  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.68 
 
 		 1653 aa  59.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1921 aa  59.3  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1653 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1653 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.43 
 
 		 1768 aa  58.9  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1898 aa  58.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  20.08 
 
 		 1641 aa  58.2  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 		 1872 aa  57.4  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  20.87 
 
 		 1839 aa  57  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.29 
 
 		 1859 aa  57.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.3 
 
 		 1872 aa  56.2  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1921 aa  55.8  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  24.64 
 
 		 2000 aa  55.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.64 
 
 		 2000 aa  55.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  25.58 
 
 		 2002 aa  55.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  22.18 
 
 		 1803 aa  55.5  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.17 
 
 		 1644 aa  55.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.96 
 
 		 1757 aa  54.7  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.85 
 
 		 1633 aa  54.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.2 
 
 		 1641 aa  54.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.88 
 
 		 1644 aa  53.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  23.51 
 
 		 1925 aa  53.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  24.03 
 
 		 1759 aa  53.5  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  23.58 
 
 		 1637 aa  53.5  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1744 aa  53.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>