173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1300 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  46.58 
 
 
1704 aa  1505    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
1737 aa  3509    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  28.99 
 
 
1559 aa  527  1e-148  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.64 
 
 
2191 aa  387  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.61 
 
 
2195 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.87 
 
 
2002 aa  377  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.48 
 
 
2002 aa  357  8.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.85 
 
 
1821 aa  321  7e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.71 
 
 
1971 aa  307  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.45 
 
 
1971 aa  302  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  25.15 
 
 
1974 aa  298  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.1 
 
 
1872 aa  280  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.2 
 
 
1916 aa  270  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  27.63 
 
 
1582 aa  257  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.39 
 
 
1352 aa  257  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.61 
 
 
1594 aa  247  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.89 
 
 
1906 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.62 
 
 
2125 aa  246  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.39 
 
 
1594 aa  244  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.74 
 
 
2057 aa  239  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.18 
 
 
1534 aa  237  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.16 
 
 
1534 aa  231  1e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.11 
 
 
1927 aa  228  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  24.62 
 
 
1603 aa  228  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  25.32 
 
 
1521 aa  226  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.95 
 
 
1869 aa  226  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  25.62 
 
 
1478 aa  220  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  25.52 
 
 
1504 aa  219  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 
1596 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  25.41 
 
 
1534 aa  218  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  25.41 
 
 
1534 aa  218  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.41 
 
 
1504 aa  217  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  25.31 
 
 
1504 aa  214  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  25.26 
 
 
1504 aa  213  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  24.1 
 
 
1921 aa  205  6e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.45 
 
 
1953 aa  193  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  23.85 
 
 
1516 aa  188  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  24 
 
 
1516 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.22 
 
 
1785 aa  186  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.56 
 
 
1823 aa  182  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.46 
 
 
1994 aa  175  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  24.18 
 
 
1925 aa  170  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.32 
 
 
1652 aa  162  7e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.67 
 
 
1653 aa  160  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.49 
 
 
1653 aa  159  4e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.49 
 
 
1653 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.49 
 
 
1653 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.56 
 
 
1653 aa  158  8e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.56 
 
 
1653 aa  158  8e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.58 
 
 
1653 aa  158  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.12 
 
 
1765 aa  157  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.23 
 
 
1653 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.86 
 
 
1935 aa  155  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.49 
 
 
1910 aa  155  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.37 
 
 
1307 aa  154  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  23.23 
 
 
1644 aa  148  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.85 
 
 
1644 aa  148  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.49 
 
 
1628 aa  147  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.63 
 
 
1832 aa  147  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.97 
 
 
1697 aa  147  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.99 
 
 
2022 aa  146  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  22.63 
 
 
1727 aa  146  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  22.99 
 
 
2036 aa  146  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.99 
 
 
2036 aa  146  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  23.09 
 
 
1646 aa  145  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.63 
 
 
1805 aa  145  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  24.22 
 
 
1815 aa  145  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.25 
 
 
1650 aa  145  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.4 
 
 
2016 aa  144  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  22.87 
 
 
2019 aa  144  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.9 
 
 
1644 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.5 
 
 
2013 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 
2013 aa  143  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.4 
 
 
2013 aa  143  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 
2007 aa  142  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.41 
 
 
1664 aa  142  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.66 
 
 
1619 aa  142  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.67 
 
 
1633 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
1633 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4845  lipoprotein, putative  22.41 
 
 
1649 aa  139  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.566822  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  22.37 
 
 
1665 aa  139  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.92 
 
 
1633 aa  139  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.04 
 
 
1663 aa  137  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.21 
 
 
1632 aa  136  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.16 
 
 
1819 aa  136  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.68 
 
 
1758 aa  135  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.71 
 
 
1807 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.81 
 
 
1768 aa  133  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.84 
 
 
1652 aa  133  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  21.83 
 
 
1993 aa  132  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.41 
 
 
2012 aa  132  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.67 
 
 
2019 aa  130  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.65 
 
 
1823 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  24.68 
 
 
1803 aa  130  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  23.31 
 
 
1808 aa  128  9e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.09 
 
 
2173 aa  127  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  23.33 
 
 
2057 aa  127  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  23.07 
 
 
1737 aa  126  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.32 
 
 
1999 aa  126  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.1 
 
 
1808 aa  125  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>