More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0415 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  32.56 
 
 
2028 aa  1019    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2084 aa  4243    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  45.42 
 
 
2025 aa  715    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  27.82 
 
 
1994 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  44.03 
 
 
2173 aa  678    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.06 
 
 
2058 aa  1021    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.65 
 
 
2019 aa  375  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  28.21 
 
 
1908 aa  324  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.04 
 
 
2125 aa  145  8e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.93 
 
 
2057 aa  140  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.79 
 
 
1704 aa  105  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  20.88 
 
 
1559 aa  101  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.78 
 
 
2002 aa  97.8  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.07 
 
 
1821 aa  93.6  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  18.78 
 
 
1737 aa  92.4  9e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  25.91 
 
 
1979 aa  83.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.93 
 
 
1916 aa  78.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.22 
 
 
2195 aa  78.6  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  43.48 
 
 
1062 aa  75.9  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  45.98 
 
 
1006 aa  73.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  36.8 
 
 
986 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  29.78 
 
 
989 aa  72  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  45.88 
 
 
1122 aa  72  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  44.12 
 
 
1202 aa  72  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.51 
 
 
2002 aa  71.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0445  TonB-dependent receptor plug  32.18 
 
 
1043 aa  71.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  32.71 
 
 
1128 aa  71.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 
1189 aa  71.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  37.21 
 
 
1110 aa  70.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  48.53 
 
 
1047 aa  71.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  43.42 
 
 
996 aa  70.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  40.43 
 
 
1043 aa  69.7  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  45.21 
 
 
1005 aa  69.7  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2221  TonB-dependent receptor plug  39.45 
 
 
1079 aa  69.7  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169798  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1064 aa  69.3  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  38.46 
 
 
1041 aa  68.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  42.39 
 
 
1116 aa  69.3  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  32.12 
 
 
1019 aa  68.9  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  43.84 
 
 
1006 aa  68.9  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.54 
 
 
1352 aa  68.9  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  27.84 
 
 
1807 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  45.07 
 
 
1034 aa  68.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 
982 aa  68.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.69 
 
 
2191 aa  68.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  44.78 
 
 
1175 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  47.89 
 
 
1017 aa  68.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1494  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 
1031 aa  68.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248152  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 
1117 aa  68.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 
1114 aa  68.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  33.6 
 
 
1003 aa  68.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  40.48 
 
 
1038 aa  67.8  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.41 
 
 
1534 aa  67.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.41 
 
 
1534 aa  67.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 
1014 aa  67.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0744  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 
1088 aa  67  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.33 
 
 
986 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  43.06 
 
 
1154 aa  67.4  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  40.3 
 
 
1084 aa  67.4  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  50.7 
 
 
1090 aa  66.6  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  28.8 
 
 
1039 aa  66.6  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1153  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 
1063 aa  66.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192441  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.79 
 
 
1872 aa  66.2  0.000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1763  TonB-dependent receptor plug  49.3 
 
 
170 aa  66.2  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  39.18 
 
 
1139 aa  66.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  44.29 
 
 
1042 aa  66.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  46.25 
 
 
1036 aa  66.2  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  43.59 
 
 
1049 aa  65.9  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  47.06 
 
 
1081 aa  65.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  41.18 
 
 
1041 aa  65.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  37.39 
 
 
1094 aa  65.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  44.16 
 
 
1066 aa  65.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  24.49 
 
 
1516 aa  65.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 
1155 aa  65.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  48.53 
 
 
1105 aa  65.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  31.43 
 
 
1060 aa  64.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  33.03 
 
 
1008 aa  64.7  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.85 
 
 
1971 aa  64.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 
1143 aa  64.7  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  31.78 
 
 
1181 aa  64.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 
1085 aa  64.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  38.95 
 
 
1177 aa  65.1  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2191  TonB-dependent receptor plug  29.7 
 
 
1219 aa  64.7  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0107052  hitchhiker  0.0000255411 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3633  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 
1010 aa  64.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 
1160 aa  64.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 
1128 aa  63.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  40.54 
 
 
1002 aa  63.9  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  41.43 
 
 
996 aa  63.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 
1080 aa  63.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1659  TonB-dependent receptor plug  35.35 
 
 
1113 aa  64.3  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 
1038 aa  63.9  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  40.43 
 
 
999 aa  63.9  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  41.46 
 
 
1014 aa  63.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4329  TonB-dependent receptor, plug  42.47 
 
 
1005 aa  63.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0305  TonB-dependent receptor plug  32.14 
 
 
1219 aa  63.5  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.146192  hitchhiker  0.000760936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 
1173 aa  63.5  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.43 
 
 
1971 aa  63.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  36.07 
 
 
1071 aa  63.5  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  39.02 
 
 
1113 aa  63.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 
1023 aa  63.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.87 
 
 
1076 aa  63.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>