More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5484 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 		 2173 aa  4481    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  41.68 
 
 		 2028 aa  652    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  44.03 
 
 		 2084 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  34.12 
 
 		 2058 aa  1125    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  40.69 
 
 		 2025 aa  644    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  39 
 
 		 1994 aa  596  1e-168  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  28.84 
 
 		 1908 aa  304  1e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.81 
 
 		 2019 aa  273  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.52 
 
 		 2125 aa  156  5e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.54 
 
 		 2002 aa  139  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.33 
 
 		 1737 aa  126  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.89 
 
 		 2002 aa  119  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.29 
 
 		 1704 aa  114  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  22.74 
 
 		 1559 aa  107  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.12 
 
 		 2057 aa  98.6  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  24.24 
 
 		 1874 aa  94.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  49.52 
 
 		 1064 aa  94.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  38.89 
 
 		 1047 aa  94  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  37.24 
 
 		 1155 aa  92.8  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  46.23 
 
 		 1102 aa  90.9  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  42.06 
 
 		 1125 aa  90.1  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.138421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  36.94 
 
 		 1102 aa  89.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 		 1026 aa  88.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4760  TonB-dependent receptor plug  36.77 
 
 		 1100 aa  87  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1161 aa  86.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  37.86 
 
 		 1155 aa  86.7  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  35.53 
 
 		 1058 aa  86.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  48.57 
 
 		 1082 aa  85.9  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  38.56 
 
 		 1189 aa  85.9  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  33.79 
 
 		 1062 aa  85.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  37.74 
 
 		 1144 aa  85.9  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2245  TonB-dependent receptor  34.25 
 
 		 1040 aa  84.3  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184688 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 		 1076 aa  84  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  36.21 
 
 		 1081 aa  83.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  39.86 
 
 		 1090 aa  82.4  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.52 
 
 		 1869 aa  82  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.44 
 
 		 1076 aa  82.4  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  36.31 
 
 		 1117 aa  81.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  40.2 
 
 		 1137 aa  81.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  37.67 
 
 		 1146 aa  80.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  41.51 
 
 		 1083 aa  80.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  41.6 
 
 		 1153 aa  80.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  35.46 
 
 		 1023 aa  80.5  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  36.13 
 
 		 1175 aa  80.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  36.81 
 
 		 1010 aa  80.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  33.51 
 
 		 1017 aa  80.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  36.23 
 
 		 1144 aa  80.5  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  40 
 
 		 1037 aa  79.7  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  34.97 
 
 		 1050 aa  79.7  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.09 
 
 		 1352 aa  79.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  35.42 
 
 		 1049 aa  78.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.98 
 
 		 1916 aa  78.6  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1070 aa  79  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  37.23 
 
 		 1079 aa  78.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  41.23 
 
 		 1024 aa  78.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  36.42 
 
 		 1084 aa  78.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1034 aa  78.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1177 aa  78.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2645  TonB-dependent receptor plug  33.97 
 
 		 1143 aa  77.8  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  42.31 
 
 		 1106 aa  78.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  36.55 
 
 		 984 aa  78.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  37.31 
 
 		 1137 aa  78.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  40.78 
 
 		 1013 aa  77.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  42.72 
 
 		 1217 aa  77.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1177 aa  78.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.75 
 
 		 1008 aa  77.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.42 
 
 		 1148 aa  77.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 1014 aa  77.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 		 1122 aa  77.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  30.69 
 
 		 1148 aa  77.4  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4946  TonB-dependent receptor plug  41.51 
 
 		 1077 aa  77  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  35.29 
 
 		 1202 aa  76.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  36.03 
 
 		 1079 aa  77  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.72 
 
 		 1168 aa  76.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 1011 aa  76.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1126  TonB-dependent receptor plug  35.25 
 
 		 1056 aa  76.3  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00950151 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  34.72 
 
 		 1018 aa  76.3  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  35.66 
 
 		 1023 aa  76.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  40.19 
 
 		 1027 aa  75.9  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  40.91 
 
 		 1038 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0277  TonB-dependent receptor plug  43.27 
 
 		 1096 aa  75.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.97163  normal  0.971813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1128 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  34.31 
 
 		 1168 aa  75.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.48 
 
 		 2191 aa  75.5  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 1138 aa  75.5  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  38.83 
 
 		 994 aa  75.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4941  TonB-dependent receptor  41.35 
 
 		 1039 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  35.17 
 
 		 1051 aa  74.7  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  33.57 
 
 		 1079 aa  74.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  38.26 
 
 		 1034 aa  74.7  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1068 aa  74.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 1019 aa  74.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 988 aa  74.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  44.32 
 
 		 1060 aa  74.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.73 
 
 		 2195 aa  73.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  39.81 
 
 		 1096 aa  74.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1858  TonB-dependent receptor plug  34.03 
 
 		 1026 aa  74.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  36.36 
 
 		 1164 aa  74.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  34.25 
 
 		 1099 aa  73.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1181 aa  73.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>