63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2204 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  100 
 
 		 1908 aa  3928    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  25.51 
 
 		 2028 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2155  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1994 aa  422  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.739326  normal  0.0698592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.54 
 
 		 2025 aa  338  9e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1214  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.28 
 
 		 2058 aa  332  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.408  unclonable  0.00000000000105563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0415  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.09 
 
 		 2084 aa  324  9.999999999999999e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336303  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.4 
 
 		 2173 aa  301  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.35 
 
 		 2019 aa  252  4e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.62 
 
 		 2057 aa  94.7  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.52 
 
 		 2002 aa  93.2  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.85 
 
 		 1906 aa  87.4  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.47 
 
 		 1916 aa  78.2  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.7 
 
 		 1352 aa  74.7  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.45 
 
 		 2125 aa  70.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  36.73 
 
 		 2195 aa  71.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.16 
 
 		 2191 aa  70.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  33.33 
 
 		 1927 aa  69.3  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.4 
 
 		 1821 aa  68.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.58 
 
 		 1534 aa  67  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.58 
 
 		 1534 aa  67  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.36 
 
 		 1704 aa  66.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  26.98 
 
 		 1874 aa  64.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  32.11 
 
 		 1559 aa  63.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  27.1 
 
 		 1869 aa  60.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.15 
 
 		 1971 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.74 
 
 		 1594 aa  57  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  33.72 
 
 		 1872 aa  56.6  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.21 
 
 		 1953 aa  56.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  27.4 
 
 		 1974 aa  56.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.54 
 
 		 2002 aa  55.8  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.02 
 
 		 1594 aa  54.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.5 
 
 		 1910 aa  53.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  31.03 
 
 		 1737 aa  52.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.35 
 
 		 1971 aa  52.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  25.28 
 
 		 1582 aa  52  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1898 aa  51.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1603 aa  51.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  35.06 
 
 		 1935 aa  51.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  24.1 
 
 		 1403 aa  50.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.4 
 
 		 1872 aa  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.4 
 
 		 1872 aa  50.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 1979 aa  49.7  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.71 
 
 		 1596 aa  50.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1516 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1516 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  29.46 
 
 		 1521 aa  49.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1807 aa  49.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  24.55 
 
 		 1921 aa  49.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.81 
 
 		 1872 aa  48.9  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1921 aa  48.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  28.92 
 
 		 1478 aa  47.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.02 
 
 		 1628 aa  47  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1534 aa  47  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  27.06 
 
 		 1534 aa  47  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  29.49 
 
 		 1504 aa  47  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  29.49 
 
 		 1504 aa  47  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.06 
 
 		 1504 aa  47  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  29.49 
 
 		 1504 aa  47  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.45 
 
 		 2020 aa  45.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.23 
 
 		 2013 aa  45.8  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  32.56 
 
 		 1737 aa  45.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.93 
 
 		 1785 aa  45.4  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  29.17 
 
 		 1925 aa  45.4  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>