135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1162 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  42.77 
 
 		 1921 aa  1396    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  38.47 
 
 		 2055 aa  998    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  39.5 
 
 		 2016 aa  1174    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  38.41 
 
 		 2067 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  37.74 
 
 		 2019 aa  1139    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  37.82 
 
 		 2064 aa  975    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  39.6 
 
 		 1993 aa  1172    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  54.09 
 
 		 1925 aa  1903    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  38.17 
 
 		 2036 aa  1138    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.28 
 
 		 2013 aa  1137    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.17 
 
 		 2036 aa  1138    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.5 
 
 		 2007 aa  1167    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.11 
 
 		 1999 aa  1122    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.49 
 
 		 2022 aa  1188    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  38.47 
 
 		 2055 aa  999    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  38.58 
 
 		 2053 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  38.47 
 
 		 2050 aa  997    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  38.45 
 
 		 2057 aa  997    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 1910 aa  3813    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  39.15 
 
 		 1994 aa  1165    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.4 
 
 		 2013 aa  1138    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  39.26 
 
 		 2006 aa  1185    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  37.65 
 
 		 2012 aa  1153    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.17 
 
 		 2022 aa  1139    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  38.06 
 
 		 2013 aa  1139    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  37.63 
 
 		 2020 aa  1163    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.59 
 
 		 1916 aa  296  3e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.22 
 
 		 1872 aa  295  4e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  26.07 
 
 		 1974 aa  266  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.67 
 
 		 1971 aa  249  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 		 1953 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.69 
 
 		 2191 aa  246  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.23 
 
 		 1971 aa  244  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.24 
 
 		 2002 aa  220  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.75 
 
 		 1906 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.07 
 
 		 1821 aa  208  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.21 
 
 		 2195 aa  208  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.11 
 
 		 2002 aa  206  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.62 
 
 		 1927 aa  178  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.83 
 
 		 1737 aa  147  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.02 
 
 		 1869 aa  142  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  22.93 
 
 		 1559 aa  129  6e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1921 aa  127  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.48 
 
 		 1823 aa  125  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1921 aa  121  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.48 
 
 		 1935 aa  115  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.97 
 
 		 1704 aa  108  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  25.23 
 
 		 1759 aa  102  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.74 
 
 		 1872 aa  97.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.99 
 
 		 1785 aa  97.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1744 aa  96.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.64 
 
 		 1872 aa  94.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.15 
 
 		 1834 aa  90.9  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.25 
 
 		 1807 aa  89.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.34 
 
 		 1872 aa  89.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  24.75 
 
 		 1737 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.49 
 
 		 1697 aa  84  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  22.12 
 
 		 2002 aa  82.8  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.4 
 
 		 1833 aa  80.1  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.7 
 
 		 2000 aa  79.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.46 
 
 		 1819 aa  79  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.35 
 
 		 1998 aa  78.6  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.35 
 
 		 1992 aa  78.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.35 
 
 		 1992 aa  78.2  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  21.81 
 
 		 2000 aa  77.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.81 
 
 		 2000 aa  77.4  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.33 
 
 		 1635 aa  75.5  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.55 
 
 		 1808 aa  74.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  22.6 
 
 		 1808 aa  74.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.46 
 
 		 1832 aa  73.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  24.27 
 
 		 1738 aa  72  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.29 
 
 		 1737 aa  70.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.44 
 
 		 1859 aa  70.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  24.41 
 
 		 1739 aa  70.5  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  20.99 
 
 		 1925 aa  70.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  20.73 
 
 		 1637 aa  67.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.58 
 
 		 1594 aa  64.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1028  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.67 
 
 		 1824 aa  63.9  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.78 
 
 		 1895 aa  62.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.33 
 
 		 1768 aa  62.4  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.09 
 
 		 1782 aa  61.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  22.02 
 
 		 1803 aa  60.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  25.12 
 
 		 1737 aa  60.1  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.47 
 
 		 1352 aa  58.2  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  22.53 
 
 		 1805 aa  57.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  28.33 
 
 		 2028 aa  55.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.52 
 
 		 1653 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  31.97 
 
 		 1411 aa  54.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.24 
 
 		 1765 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.28 
 
 		 2173 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.14 
 
 		 1594 aa  54.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.02 
 
 		 1768 aa  53.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.12 
 
 		 1823 aa  53.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.93 
 
 		 1835 aa  53.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.13 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.59 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.74 
 
 		 1897 aa  53.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.13 
 
 		 1653 aa  53.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.72 
 
 		 2125 aa  53.1  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2204  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1908 aa  52.8  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>