138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0942 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  41.98 
 
 
1921 aa  1470    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  67.92 
 
 
2055 aa  2461    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  52.99 
 
 
2016 aa  2080    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  67.98 
 
 
2067 aa  2464    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  67.79 
 
 
2019 aa  2792    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  66.62 
 
 
2064 aa  2717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  53.1 
 
 
2006 aa  2035    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  52.92 
 
 
1993 aa  2070    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  37.41 
 
 
1925 aa  1106    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  68.4 
 
 
2036 aa  2772    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.12 
 
 
2013 aa  2775    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.4 
 
 
2036 aa  2772    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  54.28 
 
 
2007 aa  2085    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.99 
 
 
1999 aa  2061    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.22 
 
 
2022 aa  2041    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  67.98 
 
 
2055 aa  2463    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  67.92 
 
 
2053 aa  2461    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  66.5 
 
 
2050 aa  2717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  67.9 
 
 
2057 aa  2461    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  37.65 
 
 
1910 aa  1143    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  51.37 
 
 
1994 aa  1986    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  69.29 
 
 
2013 aa  2793    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  54.46 
 
 
2012 aa  2128    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.45 
 
 
2022 aa  2774    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  68.02 
 
 
2013 aa  2769    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2020 aa  4120    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.08 
 
 
1916 aa  253  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.28 
 
 
1971 aa  231  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.95 
 
 
1971 aa  229  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.59 
 
 
1872 aa  223  3.9999999999999997e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  27.18 
 
 
1974 aa  222  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.3 
 
 
1821 aa  219  4e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.67 
 
 
2191 aa  206  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.13 
 
 
2195 aa  181  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24 
 
 
1953 aa  179  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.07 
 
 
2002 aa  161  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.63 
 
 
2002 aa  159  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.98 
 
 
1935 aa  148  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  20.59 
 
 
1869 aa  139  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.16 
 
 
1906 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.1 
 
 
1737 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.34 
 
 
1704 aa  115  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.64 
 
 
1823 aa  108  8e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.27 
 
 
1927 aa  108  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  21.16 
 
 
1559 aa  102  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.51 
 
 
1697 aa  94.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  22.26 
 
 
1807 aa  90.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.56 
 
 
1832 aa  89.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.09 
 
 
1759 aa  85.5  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  22.36 
 
 
1925 aa  85.1  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.38 
 
 
1603 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.33 
 
 
1834 aa  79  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.44 
 
 
1819 aa  79  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  20.49 
 
 
1504 aa  78.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  22.85 
 
 
1637 aa  76.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  20.39 
 
 
1478 aa  76.3  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  20.28 
 
 
1534 aa  75.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  20.28 
 
 
1534 aa  75.9  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.28 
 
 
1504 aa  75.5  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.67 
 
 
1596 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  21.1 
 
 
1727 aa  74.7  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.68 
 
 
1833 aa  74.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  20.39 
 
 
1504 aa  74.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25 
 
 
1785 aa  73.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.57 
 
 
1650 aa  70.5  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.36 
 
 
1582 aa  70.1  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  22.24 
 
 
1744 aa  70.1  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.54 
 
 
1737 aa  69.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.44 
 
 
1998 aa  68.6  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.44 
 
 
1992 aa  67.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.71 
 
 
1594 aa  68.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  24.26 
 
 
1808 aa  67.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  23.51 
 
 
1815 aa  67  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.85 
 
 
1758 aa  67.4  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.52 
 
 
1992 aa  67.4  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  22.67 
 
 
1504 aa  67  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.02 
 
 
1823 aa  65.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.76 
 
 
1808 aa  65.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.22 
 
 
1594 aa  63.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.5 
 
 
1765 aa  62.8  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.4 
 
 
1835 aa  62  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.64 
 
 
1897 aa  61.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  24.03 
 
 
1805 aa  61.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 
1808 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.68 
 
 
1682 aa  61.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.76 
 
 
1653 aa  60.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.26 
 
 
1743 aa  60.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  19.73 
 
 
1653 aa  60.5  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  19.73 
 
 
1653 aa  60.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.34 
 
 
1768 aa  59.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.75 
 
 
1872 aa  59.3  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.66 
 
 
1653 aa  59.3  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  20.44 
 
 
1644 aa  58.9  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.66 
 
 
1653 aa  58.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  20.67 
 
 
1921 aa  58.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  19.78 
 
 
1644 aa  58.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.75 
 
 
1872 aa  58.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  21.06 
 
 
1839 aa  58.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  20.39 
 
 
1898 aa  57.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  24.05 
 
 
1516 aa  58.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>