111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1355 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  42.69 
 
 		 1921 aa  1518    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  53.82 
 
 		 2016 aa  2082    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  52.96 
 
 		 2019 aa  2086    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  52.19 
 
 		 2064 aa  1787    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  53.76 
 
 		 1993 aa  2081    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  37.27 
 
 		 1925 aa  1117    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  52.8 
 
 		 2036 aa  2070    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.98 
 
 		 2013 aa  2070    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.8 
 
 		 2036 aa  2070    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  70.41 
 
 		 2007 aa  2878    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  70.38 
 
 		 1999 aa  2856    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  69 
 
 		 2022 aa  2784    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  37.58 
 
 		 1910 aa  1154    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 		 2012 aa  4088    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  62.92 
 
 		 1994 aa  2597    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.05 
 
 		 2013 aa  2059    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  52.85 
 
 		 2022 aa  2071    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.03 
 
 		 2013 aa  2074    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  54.43 
 
 		 2020 aa  2157    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  68.74 
 
 		 2006 aa  2786    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.82 
 
 		 1872 aa  289  5e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.84 
 
 		 1821 aa  268  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.72 
 
 		 1971 aa  261  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  25.51 
 
 		 1974 aa  258  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.7 
 
 		 1916 aa  249  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.27 
 
 		 1971 aa  248  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  58.2 
 
 		 2053 aa  234  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  57.67 
 
 		 2050 aa  232  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  57.67 
 
 		 2067 aa  232  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  57.67 
 
 		 2055 aa  232  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  57.67 
 
 		 2055 aa  232  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  57.67 
 
 		 2057 aa  232  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.54 
 
 		 1953 aa  227  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.13 
 
 		 2191 aa  218  9.999999999999999e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.88 
 
 		 2195 aa  187  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  21.11 
 
 		 1906 aa  151  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.65 
 
 		 2002 aa  150  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.71 
 
 		 2002 aa  146  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.75 
 
 		 1935 aa  143  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.25 
 
 		 1704 aa  132  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.37 
 
 		 1869 aa  122  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.73 
 
 		 1737 aa  120  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.52 
 
 		 1927 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  21.33 
 
 		 1559 aa  111  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.38 
 
 		 1823 aa  88.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.05 
 
 		 1872 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.82 
 
 		 1872 aa  74.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1898 aa  72.8  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.01 
 
 		 1872 aa  72.8  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  18.74 
 
 		 1921 aa  72.4  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  18.48 
 
 		 1921 aa  71.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1808 aa  70.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.24 
 
 		 1925 aa  70.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1603 aa  70.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.97 
 
 		 1808 aa  70.5  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  25.21 
 
 		 1759 aa  69.3  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.65 
 
 		 1697 aa  68.6  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.07 
 
 		 1807 aa  67.4  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1516 aa  67  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.29 
 
 		 1682 aa  65.5  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.6 
 
 		 1758 aa  65.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  23.82 
 
 		 1815 aa  64.7  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.85 
 
 		 1808 aa  60.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.13 
 
 		 1650 aa  61.2  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  21.22 
 
 		 1516 aa  61.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.59 
 
 		 1596 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  22.2 
 
 		 1744 aa  60.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  21.81 
 
 		 1504 aa  59.3  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.81 
 
 		 1504 aa  59.3  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  21.81 
 
 		 1504 aa  59.3  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  21.81 
 
 		 1504 aa  59.3  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  21.81 
 
 		 1534 aa  58.9  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1534 aa  58.9  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.84 
 
 		 1819 aa  58.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.92 
 
 		 1765 aa  58.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  21.81 
 
 		 1478 aa  58.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2494  hypothetical protein  27.54 
 
 		 2028 aa  57.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.415505  normal  0.0870221 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.12 
 
 		 1834 aa  57  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  37.84 
 
 		 1785 aa  56.2  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.09 
 
 		 1833 aa  56.2  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.78 
 
 		 1897 aa  55.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.09 
 
 		 1832 aa  55.5  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.25 
 
 		 1859 aa  52.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  23.86 
 
 		 1803 aa  52.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  23.7 
 
 		 1403 aa  52  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.74 
 
 		 1594 aa  52  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  22.53 
 
 		 1582 aa  51.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.5 
 
 		 2125 aa  51.2  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.86 
 
 		 1772 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.51 
 
 		 1768 aa  50.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  25.68 
 
 		 1521 aa  49.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.38 
 
 		 1594 aa  49.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  19.89 
 
 		 1644 aa  50.1  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  32.53 
 
 		 1411 aa  49.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.63 
 
 		 1768 aa  49.3  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  19.61 
 
 		 1644 aa  49.3  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  19.42 
 
 		 1637 aa  48.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1159  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.96 
 
 		 1621 aa  48.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.376607  normal  0.173941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  19.83 
 
 		 1663 aa  48.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  22.49 
 
 		 1737 aa  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>