132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6591 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  44.51 
 
 
1534 aa  1257    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  63.9 
 
 
1582 aa  1999    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  100 
 
 
1596 aa  3240    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  48.65 
 
 
1521 aa  1390    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  63.2 
 
 
1594 aa  1995    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  44.44 
 
 
1478 aa  1242    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  93.08 
 
 
1603 aa  2969    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  47.35 
 
 
1516 aa  1330    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  47.75 
 
 
1516 aa  1341    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  63.14 
 
 
1594 aa  1993    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  44.38 
 
 
1504 aa  1256    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  44.31 
 
 
1504 aa  1255    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  44.51 
 
 
1504 aa  1260    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  44.71 
 
 
1504 aa  1264    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  44.51 
 
 
1534 aa  1257    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  25.22 
 
 
1559 aa  246  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.83 
 
 
1737 aa  216  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.64 
 
 
1704 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.32 
 
 
2195 aa  188  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.99 
 
 
2191 aa  174  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.79 
 
 
1821 aa  155  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.79 
 
 
1872 aa  133  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.45 
 
 
2002 aa  104  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.37 
 
 
1916 aa  103  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.35 
 
 
2002 aa  98.2  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1095  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.49 
 
 
1628 aa  97.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  21.06 
 
 
1921 aa  95.9  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  20.81 
 
 
1921 aa  94.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.37 
 
 
1971 aa  92  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  24.06 
 
 
1974 aa  90.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.74 
 
 
1971 aa  89.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.1 
 
 
1994 aa  88.6  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.15 
 
 
1785 aa  86.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  23.54 
 
 
2002 aa  86.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  22.46 
 
 
1925 aa  84.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.67 
 
 
1823 aa  83.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.56 
 
 
1906 aa  82.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.79 
 
 
1953 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.86 
 
 
1534 aa  81.3  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.45 
 
 
1534 aa  80.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 
2057 aa  80.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.02 
 
 
2000 aa  80.5  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  24.8 
 
 
1815 aa  77.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.72 
 
 
2125 aa  78.2  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21 
 
 
1807 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  22.95 
 
 
2000 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.95 
 
 
2000 aa  76.3  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.13 
 
 
2006 aa  75.9  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.21 
 
 
1927 aa  75.9  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  21.22 
 
 
1637 aa  75.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.34 
 
 
2022 aa  74.3  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.67 
 
 
2020 aa  74.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.3 
 
 
1352 aa  73.2  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1077  alpha-2-macroglobulin family protein  23.81 
 
 
1717 aa  72.4  0.00000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0094392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.96 
 
 
1635 aa  71.6  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0264  alpha-2-macroglobulin-like  21.29 
 
 
1803 aa  70.5  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.678468 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.76 
 
 
1782 aa  70.9  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 
1765 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  21.06 
 
 
1921 aa  70.5  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  24.77 
 
 
1869 aa  69.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  22.89 
 
 
2055 aa  68.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  23.05 
 
 
2067 aa  68.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.77 
 
 
1307 aa  68.9  0.0000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  22.94 
 
 
2053 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  23.05 
 
 
2050 aa  68.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.22 
 
 
1819 aa  68.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  23.05 
 
 
2055 aa  68.6  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  23 
 
 
2057 aa  67.8  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  21.23 
 
 
1665 aa  67  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2979  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.19 
 
 
1998 aa  65.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.31 
 
 
1872 aa  65.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3053  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.19 
 
 
1992 aa  65.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.17 
 
 
1641 aa  64.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1880  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.88 
 
 
1992 aa  63.9  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0009665 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1501  alpha-2-macroglobulin family N-terminal region domain protein  21.46 
 
 
1761 aa  63.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.55 
 
 
1999 aa  62.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  21.34 
 
 
2064 aa  62  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.11 
 
 
1835 aa  61.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.21 
 
 
1872 aa  61.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1294  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.67 
 
 
1897 aa  60.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.448115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3210  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.54 
 
 
2025 aa  60.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.150247  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  23 
 
 
1641 aa  60.5  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
1832 aa  60.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.12 
 
 
2013 aa  60.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5484  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.08 
 
 
2173 aa  60.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  21.25 
 
 
1898 aa  59.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.78 
 
 
1772 aa  59.3  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.26 
 
 
2007 aa  58.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.6 
 
 
1768 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.78 
 
 
1772 aa  58.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  21.59 
 
 
2016 aa  58.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.36 
 
 
1823 aa  58.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  25.65 
 
 
2036 aa  57  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.65 
 
 
2036 aa  57  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.66 
 
 
1808 aa  57  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.65 
 
 
2022 aa  56.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1707  A-macroglobulin like protein  28.51 
 
 
1403 aa  56.6  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.780753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.9 
 
 
1697 aa  56.2  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3167  A-macroglobulin complement component  26.07 
 
 
1411 aa  56.2  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.541025  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.1 
 
 
1619 aa  55.8  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>