144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3110 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1921 aa  1488    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  54.86 
 
 		 2016 aa  2114    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  53.31 
 
 		 2067 aa  1793    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  53.2 
 
 		 2019 aa  2065    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  70.49 
 
 		 2006 aa  2824    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  53.43 
 
 		 2064 aa  1783    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  54.09 
 
 		 1993 aa  2073    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  38.11 
 
 		 1925 aa  1134    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  53.14 
 
 		 2036 aa  2049    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.62 
 
 		 2013 aa  2060    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.14 
 
 		 2036 aa  2049    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  72.03 
 
 		 2007 aa  2910    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 1999 aa  4054    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  70.44 
 
 		 2022 aa  2809    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  53.37 
 
 		 2053 aa  1795    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  53.2 
 
 		 2050 aa  1788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  37.84 
 
 		 1910 aa  1144    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  70.53 
 
 		 2012 aa  2888    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  64.66 
 
 		 1994 aa  2606    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.79 
 
 		 2013 aa  2058    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.19 
 
 		 2022 aa  2051    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  53.3 
 
 		 2013 aa  2065    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  54.14 
 
 		 2020 aa  2106    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.73 
 
 		 1872 aa  259  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.85 
 
 		 1953 aa  246  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.64 
 
 		 1821 aa  244  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.61 
 
 		 1916 aa  243  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.04 
 
 		 1971 aa  239  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  58.95 
 
 		 2055 aa  238  8e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  58.95 
 
 		 2055 aa  238  8e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  58.95 
 
 		 2057 aa  238  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.55 
 
 		 1971 aa  230  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  27.97 
 
 		 1974 aa  227  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.58 
 
 		 2191 aa  212  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.4 
 
 		 2195 aa  186  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.86 
 
 		 2002 aa  151  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.66 
 
 		 2002 aa  149  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.38 
 
 		 1737 aa  142  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  20.85 
 
 		 1906 aa  140  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.02 
 
 		 1823 aa  131  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  21.81 
 
 		 1559 aa  124  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.85 
 
 		 1704 aa  119  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.94 
 
 		 1935 aa  111  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0402  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.86 
 
 		 1765 aa  109  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.882567  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1808 aa  108  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.2 
 
 		 1869 aa  107  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0024  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.16 
 
 		 1808 aa  106  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1736  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.93 
 
 		 1758 aa  103  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0148696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.17 
 
 		 1927 aa  101  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  19.48 
 
 		 1807 aa  100  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.21 
 
 		 1808 aa  96.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.617049  normal  0.166379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.13 
 
 		 1737 aa  95.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1630  hypothetical protein  20.17 
 
 		 1921 aa  95.5  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.29 
 
 		 1594 aa  95.5  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  20.33 
 
 		 1921 aa  94.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.2 
 
 		 1833 aa  94.4  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.4 
 
 		 1594 aa  93.6  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.34 
 
 		 1819 aa  92.8  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  21.93 
 
 		 1925 aa  92.8  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  25 
 
 		 1737 aa  92.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.56 
 
 		 1785 aa  91.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1670  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.9 
 
 		 1772 aa  89  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  0.347856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  20.61 
 
 		 1637 aa  88.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.83 
 
 		 1768 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0389  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal 2  22.44 
 
 		 1727 aa  83.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188526  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2773  alpha-2-macroglobulin-like  22.87 
 
 		 1815 aa  83.2  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.824984 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  21.92 
 
 		 1582 aa  82  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.7 
 
 		 1772 aa  82.4  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  21.02 
 
 		 1603 aa  82  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1743 aa  82  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  22.7 
 
 		 1478 aa  79.7  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2078  alpha-2-macroglobulin-like  23.71 
 
 		 1738 aa  79.7  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  22.86 
 
 		 1739 aa  79  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2471  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.86 
 
 		 1697 aa  78.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000406567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  23.48 
 
 		 1898 aa  77.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2919  Alpha-2-macroglobulin-like protein  23.14 
 
 		 1737 aa  77.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.29 
 
 		 1782 aa  76.6  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.81 
 
 		 1596 aa  76.3  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7153  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.01 
 
 		 1835 aa  75.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.847476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.58 
 
 		 1872 aa  74.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1120  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.29 
 
 		 1768 aa  74.3  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.96 
 
 		 1823 aa  73.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.41 
 
 		 1872 aa  73.2  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  21.87 
 
 		 1644 aa  72.8  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1834 aa  72  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.24 
 
 		 1872 aa  72  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.36 
 
 		 1652 aa  71.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  24.67 
 
 		 1534 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  24.67 
 
 		 1534 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.67 
 
 		 1504 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.67 
 
 		 1504 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  24.67 
 
 		 1504 aa  70.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1653 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0104  Alpha-2-macroglobulin-like protein  25.28 
 
 		 1759 aa  70.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0259  alpha-2-macroglobulin-like  23.31 
 
 		 1805 aa  70.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  21.82 
 
 		 1644 aa  70.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.67 
 
 		 1504 aa  70.9  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  21.24 
 
 		 1653 aa  70.5  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.3 
 
 		 1653 aa  70.1  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.64 
 
 		 1644 aa  70.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>