187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2604 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.36 
 
 		 2002 aa  998    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  77.72 
 
 		 2191 aa  3389    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.29 
 
 		 2002 aa  986    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 		 2195 aa  4352    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.7 
 
 		 1916 aa  554  1e-156  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.74 
 
 		 1971 aa  554  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  30.14 
 
 		 1974 aa  549  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  29.69 
 
 		 1971 aa  544  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.34 
 
 		 1872 aa  491  1e-137  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.82 
 
 		 1821 aa  493  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  26.4 
 
 		 1559 aa  427  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.6 
 
 		 1869 aa  366  3e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.28 
 
 		 1704 aa  363  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.82 
 
 		 1737 aa  362  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  23.67 
 
 		 1906 aa  343  2.9999999999999998e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.33 
 
 		 1927 aa  340  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.12 
 
 		 1953 aa  302  4e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.08 
 
 		 1823 aa  288  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  22.13 
 
 		 1807 aa  276  3e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.03 
 
 		 1819 aa  248  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.63 
 
 		 1859 aa  224  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.79 
 
 		 1748 aa  216  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.28 
 
 		 1785 aa  212  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.21 
 
 		 1910 aa  209  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.07 
 
 		 1994 aa  205  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.43 
 
 		 2013 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  26.5 
 
 		 2016 aa  203  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.92 
 
 		 1352 aa  203  3e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1921 aa  203  3.9999999999999996e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  26.4 
 
 		 2050 aa  202  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.25 
 
 		 2013 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  26.3 
 
 		 2053 aa  201  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  26.4 
 
 		 2067 aa  200  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26 
 
 		 2013 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  26.35 
 
 		 2057 aa  199  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  26.3 
 
 		 2055 aa  199  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  25.9 
 
 		 1925 aa  198  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  26.21 
 
 		 2055 aa  197  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.23 
 
 		 1935 aa  197  3e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  26.87 
 
 		 2064 aa  194  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  27.07 
 
 		 2057 aa  193  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.26 
 
 		 2020 aa  193  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  26.02 
 
 		 2019 aa  192  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1603 aa  191  9e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.32 
 
 		 2006 aa  191  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  26.01 
 
 		 2036 aa  191  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.01 
 
 		 2036 aa  191  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.95 
 
 		 1534 aa  191  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.01 
 
 		 2022 aa  190  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.77 
 
 		 1534 aa  189  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.48 
 
 		 2022 aa  189  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.46 
 
 		 1596 aa  188  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.02 
 
 		 2007 aa  188  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.4 
 
 		 1757 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1516 aa  186  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  25.73 
 
 		 1521 aa  184  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  25.99 
 
 		 1993 aa  182  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.16 
 
 		 2125 aa  182  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58250  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1516 aa  176  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1355  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.74 
 
 		 2012 aa  176  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.402585  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.21 
 
 		 1999 aa  172  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.81 
 
 		 1653 aa  172  8e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.83 
 
 		 1653 aa  171  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.83 
 
 		 1653 aa  171  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.83 
 
 		 1653 aa  169  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.77 
 
 		 1653 aa  169  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1653 aa  168  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  22.75 
 
 		 1653 aa  168  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.71 
 
 		 1652 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  26.5 
 
 		 1582 aa  166  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1390  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.5 
 
 		 1768 aa  166  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.856631  normal  0.708848 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.89 
 
 		 1653 aa  165  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.96 
 
 		 1594 aa  164  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.67 
 
 		 1872 aa  162  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.69 
 
 		 1872 aa  162  5e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.06 
 
 		 1594 aa  160  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1839 aa  155  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  22.37 
 
 		 1644 aa  151  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 		 1872 aa  151  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  22.11 
 
 		 1644 aa  150  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0602  6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating  21.42 
 
 		 1637 aa  149  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.501993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  22.04 
 
 		 1644 aa  147  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  22.21 
 
 		 1646 aa  147  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0163  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.64 
 
 		 1864 aa  147  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  24.13 
 
 		 1534 aa  146  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  24.13 
 
 		 1534 aa  146  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.13 
 
 		 1504 aa  146  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  24.13 
 
 		 1504 aa  145  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.77 
 
 		 1632 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2137  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1834 aa  143  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  24.04 
 
 		 1478 aa  143  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1529  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.07 
 
 		 1895 aa  142  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.753642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0136  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.59 
 
 		 1307 aa  142  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.317886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  24.23 
 
 		 1504 aa  142  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1395  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.7 
 
 		 1772 aa  140  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.985973  normal  0.0111299 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  23.86 
 
 		 1504 aa  140  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.55 
 
 		 1652 aa  140  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0067  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.42 
 
 		 1682 aa  140  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0270  hypothetical protein  25.18 
 
 		 1744 aa  139  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0066  hypothetical protein  22.71 
 
 		 1898 aa  139  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>