100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1097 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  100 
 
 		 1748 aa  3401    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  62.09 
 
 		 1757 aa  2041    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  30.54 
 
 		 1708 aa  342  5e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.7 
 
 		 2191 aa  293  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.53 
 
 		 2002 aa  229  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.24 
 
 		 2002 aa  223  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.79 
 
 		 2195 aa  219  4e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0161  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1591 aa  140  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.330881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 		 1737 aa  105  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.07 
 
 		 1821 aa  104  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.03 
 
 		 1971 aa  89  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.64 
 
 		 1686 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.42 
 
 		 1823 aa  86.7  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  27.91 
 
 		 595 aa  79  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  30.74 
 
 		 4761 aa  77.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.09 
 
 		 1872 aa  77.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 		 2019 aa  74.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  21.24 
 
 		 1559 aa  73.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.28 
 
 		 1819 aa  73.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.52 
 
 		 1971 aa  72.8  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.34 
 
 		 1594 aa  68.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.05 
 
 		 1594 aa  67.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.88 
 
 		 1619 aa  67.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.87 
 
 		 1704 aa  66.6  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.03 
 
 		 1935 aa  65.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.71 
 
 		 1906 aa  64.7  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  19.54 
 
 		 1916 aa  63.2  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.08 
 
 		 1635 aa  62.4  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  20.91 
 
 		 1927 aa  62.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  23.52 
 
 		 1974 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  20.58 
 
 		 1807 aa  60.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  24.51 
 
 		 651 aa  60.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3200  TonB-dependent receptor plug  18.44 
 
 		 1979 aa  59.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.257633 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  24.15 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  21.25 
 
 		 1869 aa  58.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.07 
 
 		 1653 aa  57.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  22.29 
 
 		 1521 aa  57.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.83 
 
 		 1352 aa  57  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  23.87 
 
 		 656 aa  57.4  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.15 
 
 		 693 aa  56.2  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  26.27 
 
 		 1582 aa  56.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2573  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1603 aa  55.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0188511  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.46 
 
 		 1652 aa  55.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1653 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1653 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  22.69 
 
 		 4697 aa  55.5  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  29.46 
 
 		 1590 aa  54.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.19 
 
 		 1785 aa  53.5  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.48 
 
 		 1534 aa  52.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  25.51 
 
 		 1644 aa  52.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.64 
 
 		 1653 aa  52.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  24.56 
 
 		 1627 aa  52.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.64 
 
 		 1653 aa  52.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.15132 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.64 
 
 		 1653 aa  52  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  24 
 
 		 486 aa  52  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  26.91 
 
 		 1838 aa  52  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.53 
 
 		 1534 aa  51.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1636  hypothetical protein  20.47 
 
 		 1921 aa  51.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  25 
 
 		 1746 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  25.23 
 
 		 1646 aa  51.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.49 
 
 		 1653 aa  51.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6591  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.66 
 
 		 1596 aa  50.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.509097  normal  0.0153598 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1026 aa  50.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  28.25 
 
 		 648 aa  51.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1644 aa  50.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0544  large extracellular alpha-helical protein  25.48 
 
 		 1925 aa  50.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1644 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4952  putative large extracellular alpha-helical protein  20 
 
 		 1874 aa  50.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317972  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02113  hypothetical protein  23 
 
 		 1534 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02154  putative membrane protein  23 
 
 		 1534 aa  49.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  35.92 
 
 		 1627 aa  49.7  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1423  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.83 
 
 		 1504 aa  49.7  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.427509  decreased coverage  0.0000103653 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  24.34 
 
 		 692 aa  49.3  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  19.21 
 
 		 3320 aa  49.3  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2823  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.5 
 
 		 1737 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2376  alpha-2-macroglobulin family protein  22.45 
 
 		 1504 aa  48.5  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2551  alpha-2-macroglobulin-like  24.68 
 
 		 1737 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.11715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2368  alpha-2-macroglobulin family protein  22.45 
 
 		 1504 aa  47.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  26.63 
 
 		 766 aa  48.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2523  alpha-2-macroglobulin family protein  22.66 
 
 		 1504 aa  48.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659146  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.72 
 
 		 1653 aa  47.8  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3110  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.67 
 
 		 1999 aa  48.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.49 
 
 		 1663 aa  47.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.84 
 
 		 1859 aa  47  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2364  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 		 1833 aa  47.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12539  lipoprotein lppS  25.43 
 
 		 408 aa  47  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.43439e-50  hitchhiker  0.00210001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2542  alpha-2-macroglobulin-like  22.3 
 
 		 1737 aa  47  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380531  normal  0.505843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.7 
 
 		 1650 aa  46.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1535  extracellular alpha-helical protein  23.35 
 
 		 1739 aa  46.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232844  normal  0.84967 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.54 
 
 		 1872 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3259  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.67 
 
 		 1782 aa  46.2  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959704  normal  0.986614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2328  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.07 
 
 		 433 aa  46.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580802  normal  0.335133 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2281  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  27.07 
 
 		 433 aa  46.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2320  hypothetical protein  27.07 
 
 		 446 aa  45.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0861807 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3362  alpha-2-macroglobulin family protein  27.7 
 
 		 1478 aa  45.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.65 
 
 		 2125 aa  45.8  0.008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.52 
 
 		 1854 aa  45.4  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0066  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.76 
 
 		 1872 aa  45.4  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  32.38 
 
 		 14944 aa  45.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  23.69 
 
 		 1921 aa  45.4  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>