57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1914 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1178    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  64.33 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  61.43 
 
 		 482 aa  538  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  48.35 
 
 		 368 aa  278  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  54.11 
 
 		 258 aa  220  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  33.88 
 
 		 656 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  49.38 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  33.23 
 
 		 651 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  48.9 
 
 		 1183 aa  185  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  44.44 
 
 		 810 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  33.11 
 
 		 663 aa  160  7e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  41.3 
 
 		 410 aa  147  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  43.11 
 
 		 1700 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.79 
 
 		 648 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.93 
 
 		 1590 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  35.44 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  32.74 
 
 		 352 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  33.65 
 
 		 4761 aa  97.4  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  32.16 
 
 		 1686 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  37.96 
 
 		 1627 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1838 aa  91.3  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  30.03 
 
 		 1762 aa  90.1  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.93 
 
 		 2002 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  35.71 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  42.76 
 
 		 892 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.43 
 
 		 2002 aa  84.7  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  42.03 
 
 		 739 aa  83.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  30.97 
 
 		 678 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  27.91 
 
 		 1748 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  29.04 
 
 		 1757 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  36.36 
 
 		 2135 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  34.93 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  38.41 
 
 		 631 aa  63.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  27.87 
 
 		 693 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  28.62 
 
 		 4697 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  25.23 
 
 		 1026 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  36.52 
 
 		 767 aa  57.4  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  35.14 
 
 		 3586 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  42.16 
 
 		 665 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1627 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  27.58 
 
 		 3925 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1282 aa  55.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.2 
 
 		 4379 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  37.4 
 
 		 665 aa  53.5  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.8 
 
 		 2195 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  39.45 
 
 		 685 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  24.17 
 
 		 635 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  20.71 
 
 		 2191 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  26.76 
 
 		 1669 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1785 aa  52  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  33.66 
 
 		 577 aa  50.8  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1022  hypothetical protein  31.97 
 
 		 1933 aa  50.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  26.81 
 
 		 692 aa  50.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  27.34 
 
 		 824 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  36.17 
 
 		 978 aa  48.9  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.57 
 
 		 1708 aa  48.5  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  36.21 
 
 		 536 aa  48.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>