50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0232 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  100 
 
 
368 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  48.05 
 
 
595 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  46.63 
 
 
482 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  47.08 
 
 
486 aa  249  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  55.96 
 
 
1183 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  56.05 
 
 
526 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  53.64 
 
 
410 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  49.38 
 
 
810 aa  218  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  48.42 
 
 
258 aa  195  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  47.47 
 
 
1700 aa  169  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.31 
 
 
663 aa  119  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  32.99 
 
 
651 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  32.37 
 
 
656 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  35.48 
 
 
412 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  33.8 
 
 
678 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  32.11 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  30.92 
 
 
648 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  31.62 
 
 
892 aa  77  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  34.56 
 
 
739 aa  76.3  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  46 
 
 
352 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40.8 
 
 
1590 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  40.2 
 
 
1686 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  40.19 
 
 
2135 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  40.19 
 
 
665 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  39.62 
 
 
1762 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  30.59 
 
 
631 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  35.56 
 
 
978 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  31.51 
 
 
398 aa  60.1  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  38 
 
 
1026 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  38 
 
 
665 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  42.98 
 
 
1627 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  43.4 
 
 
1282 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  33.03 
 
 
767 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.48 
 
 
685 aa  53.5  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  37.5 
 
 
693 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  36.67 
 
 
4761 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  36.84 
 
 
2191 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  35.58 
 
 
635 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.68 
 
 
995 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  31.13 
 
 
555 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  33.94 
 
 
1838 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  34.91 
 
 
536 aa  46.6  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  36.67 
 
 
1669 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  34.19 
 
 
692 aa  46.6  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  34.88 
 
 
2002 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  38.24 
 
 
3586 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  33.33 
 
 
1785 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  34.23 
 
 
3925 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  35.24 
 
 
1627 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1722  hypothetical protein  29.06 
 
 
1013 aa  43.1  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.919333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>