49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6489 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1241    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  67.51 
 
 		 1051 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  49.54 
 
 		 1785 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  52.08 
 
 		 412 aa  180  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  46.44 
 
 		 1744 aa  177  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  46.8 
 
 		 1728 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  54.43 
 
 		 1838 aa  173  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  43.59 
 
 		 1009 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  43.55 
 
 		 2337 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  47.34 
 
 		 2135 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  52.53 
 
 		 1781 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  51.9 
 
 		 1752 aa  156  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  51.59 
 
 		 1282 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  50 
 
 		 1627 aa  155  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  46.6 
 
 		 374 aa  137  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  46 
 
 		 1589 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  42.86 
 
 		 678 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4029  hypothetical protein  42.77 
 
 		 824 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0283808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  40.7 
 
 		 739 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1924  hypothetical protein  41.94 
 
 		 523 aa  118  3e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.9 
 
 		 1066 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  43.14 
 
 		 1005 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1378  fibronectin type III domain-containing protein  42.42 
 
 		 430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0649  hypothetical protein  35.23 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1183 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2328  hypothetical protein  52.87 
 
 		 119 aa  97.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  37.31 
 
 		 1389 aa  92.8  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  34.47 
 
 		 810 aa  92  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  34.25 
 
 		 1700 aa  90.5  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  34.53 
 
 		 892 aa  89.7  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  33.18 
 
 		 410 aa  87  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  37.95 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  36.06 
 
 		 526 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  36.32 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  34.93 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  35.51 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  31.51 
 
 		 368 aa  72.8  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  32.89 
 
 		 595 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  39.68 
 
 		 663 aa  65.9  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  36.88 
 
 		 656 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  31.54 
 
 		 651 aa  60.8  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  34.71 
 
 		 648 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0450  protease  38.05 
 
 		 1207 aa  54.3  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.470359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  44.21 
 
 		 487 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  36.54 
 
 		 1126 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  54.84 
 
 		 1695 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  38.78 
 
 		 730 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3230  Ig-like, group 2  37.25 
 
 		 1245 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16456  normal  0.0136569 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>