26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1480 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  63.06 
 
 
1183 aa  757    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  100 
 
 
1700 aa  3245    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  65.16 
 
 
810 aa  263  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  55.72 
 
 
410 aa  261  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  56.84 
 
 
526 aa  226  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  47.73 
 
 
368 aa  183  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0313  PKD domain-containing protein  63.27 
 
 
401 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  43.58 
 
 
258 aa  148  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  41.95 
 
 
486 aa  144  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  42.86 
 
 
412 aa  134  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  42.54 
 
 
595 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  42.62 
 
 
482 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  35.51 
 
 
892 aa  108  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  34.75 
 
 
678 aa  101  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  33.33 
 
 
374 aa  94.4  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.8 
 
 
663 aa  90.1  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  35.48 
 
 
656 aa  88.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  38.06 
 
 
739 aa  86.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  39.62 
 
 
651 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  36.86 
 
 
631 aa  78.6  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  32.58 
 
 
648 aa  72.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  33.48 
 
 
398 aa  69.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  28.44 
 
 
448 aa  52.4  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0848  hypothetical protein  38.46 
 
 
433 aa  47.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1441  hypothetical protein  31.51 
 
 
2138 aa  47.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  34 
 
 
3027 aa  45.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>